圣犹大儿童研究医院、西雅图儿童医院和儿童肿瘤学组 (COG) 的科学家发现了影响标准风险 B 细胞急性淋巴细胞白血病(SR B-ALL) 儿童复发风险的新型基因变异,SR B-ALL 是最常见的儿童癌症。SR B-ALL 复发的基因组预测因子的确定为改进诊断、精确调整治疗强度以及开发新型治疗方法提供了基础。这项研究今天发表在《临床肿瘤学杂志》上。
标准风险 ALL 预后良好,缓解率超过 90%。然而,约 15% 获得缓解的患者后来会复发。之前通过基因改变预测复发风险的研究主要集中在高风险 ALL 亚群。SR B-ALL 代表了更大的患者群体,约占复发 ALL 儿童的一半。这项研究是首批系统性地大规模研究影响 SR B-ALL 复发风险的遗传因素的研究之一。
ALL 是最常见的儿童癌症,治愈率超过 90%,这是一个巨大的成功案例。但仍有一部分儿童的疾病没有完全治愈,我们还没有完全理解为什么会这样。这项研究重点关注的是这组不太了解的病例,我们对影响治疗无效和疾病复发风险的特征了解较少。”
Charles Mullighan,医学学士(荣誉学位)、理学硕士、医学博士,圣犹达综合癌症中心副主任兼病理学系成员,共同资深作者
识别调节风险的基因变异
基因组分析可识别与癌症易感性、复发风险以及肿瘤对治疗的反应相关的特定基因变异。这些研究使科学家和临床医生能够预测患者对治疗的反应,从而为儿童 ALL 的治疗提供参考。这项合作研究的结果表明,基因组分析与传统标准相结合,在准确确定 B-ALL 患者风险方面具有重要意义。
“我们计划在未来减少对 ALL 儿童的常规疗法,因为我们知道许多患者可以通过更少的疗法治愈,”共同资深作者、西雅图儿童癌症和血液病中心负责人、COG ALL 委员会名誉主席、西雅图儿童 Ben Towne 儿童癌症研究中心主任、西雅图儿童血液学、肿瘤学、骨髓移植和细胞治疗部门负责人 Mignon Loh 医学博士解释说。“我们希望确保准确识别这些儿童,由于研究的特殊设计,这个项目让我们能够做到这一点。”
科学家以一比二的比例对复发的 SR B-ALL 样本和保持完全缓解的样本进行了基因组和转录组测序。他们发现 ALL 亚型、基因变异和非整倍体模式(额外的或缺失的染色体)与复发风险和复发时间有关。一些 B-ALL 亚型,如超二倍体和ETV6::RUNX1 ALL,复发频率较低,但其他亚型,包括PAX5变异、TCF3/4::HLF、ETV6::RUNX1 样和BCR::ABL1 样,与复发风险增加有关。值得注意的是,这些 B-ALL 亚型中特定类型的基因变异进一步影响复发风险。这项研究表明,基因变异和癌症亚型影响 SR B-ALL 的复发风险,被归类为标准风险的患者可能患有具有高风险特征的肿瘤。
Mullighan 解释道:“全基因组测序对于准确全面地识别这些变化非常重要,如果没有全基因组测序,就不可能识别出所有变化。患有 SR ALL 的儿童在初次诊断时应对其肿瘤细胞基因组进行测序,以确定他们的肿瘤细胞是否具有这些高风险特征,以便增加他们的初始治疗强度。”
“除了传统疗法之外,这些信息还可以用于开发和探索新的个性化治疗策略,”Loh 补充道。