HRD
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同源重组修复缺陷(Homologous Recombination Deficiency,简称 HRD),是指细胞由于遗传变异或表观遗传失活,导致其无法通过**同源重组修复**(HRR)途径修复 DNA **双链断裂**(DSBs)的一种状态。HRD 会导致基因组产生特定的、可识别的损伤积聚(即“**基因组瘢痕**”)。在临床肿瘤学中,HRD 是预测卵巢癌、乳腺癌、前列腺癌等对 **PARP抑制剂** 及铂类化疗药物敏感性的关键生物标志物。
分子机制:同源重组的缺失
DNA 的双链断裂是最严重的遗传损伤形式。正常细胞通过两种主要途径修复 DSBs:**非同源末端连接**(NHEJ)和**同源重组修复**(HRR)。
- **HRR 途径**:一种高保真的修复方式,利用姊妹染色单体作为模板,确保序列完整。核心蛋白包括 $BRCA1$、$BRCA2$、$PALB2$、$RAD51$ 等。
- **缺陷后果**:当 HRR 相关基因发生功能缺失(dHRR)时,细胞被迫转向低保真的 NHEJ 或 **微同源末端连接**(MMEJ)途径。这会导致染色体发生大规模的重排,形成**基因组瘢痕**。
基因组瘢痕:HRD 的数字化定义
目前临床广泛采用的 **HRD Score**(或称 GIS 评分)是由三种基因组改变类型的加权总和构成的:
- **杂合性丢失 (LOH)**:染色体特定区域的一个等位基因丢失,导致遗传信息的单一化。
- **端粒等位基因不平衡 (TAI)**:染色体端粒附近的等位基因比例偏离正常,代表了亚染色体尺度的不稳定性。
- **大规模状态转换 (LST)**:相邻两个染色体片段(长度 > 10Mb)之间发生断裂和易位。
计算公式通常简化表述为: $$ \text{HRD Score} = \sum (\text{LOH Count} + \text{TAI Count} + \text{LST Count}) $$ 当评分超过特定阈值(如 42 分)时,判定为 **HRD 阳性**。
临床应用:合成致死效应
HRD 的发现为“**合成致死**”理论提供了完美的临床范式。
- **作用原理**:PARP 酶负责修复 DNA 的**单链断裂**(SSBs)。在正常细胞中,阻断 PARP 会导致 SSBs 转化为 DSBs,但 HRR 途径可以修复。在 HRD 肿瘤细胞中,由于 HRR 已失效,PARP 抑制导致 DSBs 无法修复,最终诱发癌细胞凋亡。
- **伴随诊断**:WES 或基于 NGS 的 Targeted Panels 已被获批用于筛选受益于奥拉帕利、尼拉帕利等药物的患者。
生物标志物特征对比
| 标志物 | 发生机制 (Mechanism) | 临床主要价值 (Clinical Value) |
|---|---|---|
| **HRD** | 同源重组修复途径失效。 | 预测 **PARP 抑制剂** 敏感性。 |
| **MSI** | 错配修复 (MMR) 系统缺陷。 | 预测 **PD-1 免疫治疗** 敏感性。 |
| **TMB** | 全基因组范围突变累积。 | 衡量肿瘤免疫原性。 |
参考文献
- [1] **Lord CJ, Ashworth A**. **PARP inhibitors: Synthetic lethality in the clinic.** Science. 2017.
- [2] **Telli ML, et al**. **Homologous Recombination Deficiency (HRD) Score Predicts Response to Platinum-Based Neoadjuvant Chemotherapy.** Clinical Cancer Research. 2016.
- [3] **Mirza MR, et al**. **Niraparib Maintenance Therapy in Platinum-Sensitive, Recurrent Ovarian Cancer.** NEJM. 2016.