背景
现在，大量证据证明，人体内微生物群落对人类健康和疾病起着至关重要的作用。然而，关于微生物群在健康中的作用的研究很大一部分集中在肠道微生物群上。研究表明，上呼吸道微生物群与呼吸系统健康密切相关，在决定呼吸道感染的易感性方面起着重要作用。
上呼吸道微生物群还会影响慢性呼吸道疾病的易感性，包括慢性阻塞性肺病、哮喘和心血管疾病。呼吸道内环境的多样性为微生物群落提供了各种生态位，而微生物群落又充当病原体的屏障，并与粘膜中的免疫系统相互作用，保护呼吸系统。
关于研究
在目前的研究中，研究人员分析了荷兰人口横断面的鼻咽、口咽和唾液样本的微生物组成和多样性，以表征整个生命周期内上呼吸道微生物组的变化，并研究其与宿主和环境的关系。
研究人员分别从 10 岁以下和 10 岁以上的儿童身上采集了代表上呼吸道口腔环境的唾液和口咽样本，并从所有研究参与者身上采集了鼻咽样本。研究人员确保研究人群真实代表了荷兰人口，并充分覆盖了居住在疫苗覆盖率较低的地区的社区。
问卷调查收集了社会人口统计数据和疾病状况、疫苗接种率、饮食和行为等信息。从所有样本中提取脱氧核糖核酸 (DNA)，并使用聚合酶链反应 (PCR) 进行处理，以扩增 16S 核糖体核糖核酸 (rRNA) 基因的高变区 4。
此外，还使用定量 PCR 确定样本中的细菌负荷。采用生物信息学流程推断扩增子序列变体并分配分类学。此外，还进行了单重定量 PCR 以检测肺炎链球菌的存在。该过程使用针对肺炎球菌铁吸收三磷酸腺苷 (ATP) 合酶结合盒 (ABC) 转运脂蛋白和肺炎球菌自溶素的引物。
研究人员进行了主坐标分析，以评估整个生命周期中微生物群落组成变化，并观察上呼吸道生态位之间的微生物群落差异。研究人员还计算了 alpha 多样性，即口腔和鼻咽生态位内的微生物多样性。
