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微滴数字PCR
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<div style="padding: 0 4%; line-height: 1.8; color: #1e293b; font-family: 'Helvetica Neue', Helvetica, 'PingFang SC', Arial, sans-serif; background-color: #ffffff; max-width: 1200px; margin: auto;"> <div style="margin-bottom: 30px; border-bottom: 1.2px solid #e2e8f0; padding-bottom: 25px;"> <p style="font-size: 1.1em; margin: 10px 0; color: #334155; text-align: justify;"> <strong>[[微滴数字PCR]] (Droplet Digital PCR, ddPCR)</strong> 是一种基于<strong>[[微流控技术]]</strong>的第三代 PCR 技术。它通过将微量的 DNA 反应体系物理分割成成千上万个纳升级的油包水微滴(Droplets),使每个微滴作为一个独立的 PCR 反应器进行扩增。反应结束后,系统对每个微滴进行“有/无”荧光信号的二元计数(0 或 1),最后利用 <strong>[[泊松分布]] (Poisson Distribution)</strong> 统计学原理计算出靶分子的<strong>[[绝对拷贝数]]</strong>。与传统的 <strong>[[qPCR]]</strong> 相比,ddPCR 无需标准曲线即可实现绝对定量,且在检测<strong>[[稀有突变]]</strong>、<strong>[[拷贝数变异]] (CNV)</strong> 及抗抑制能力方面具有显著优势,是目前<strong>[[液体活检]]</strong>领域的金标准技术之一。 </p> </div> <div class="medical-infobox mw-collapsible mw-collapsed" style="width: 320px; float: right; margin: 0 0 25px 25px; border: 1.2px solid #bae6fd; border-radius: 12px; background-color: #ffffff; box-shadow: 0 8px 20px rgba(0,0,0,0.05); overflow: hidden;"> <div style="padding: 15px; color: #1e40af; background: linear-gradient(135deg, #e0f2fe 0%, #bae6fd 100%); text-align: center; cursor: pointer;"> <div style="font-size: 1.2em; font-weight: bold; letter-spacing: 1.2px;">微滴数字PCR</div> <div style="font-size: 0.7em; opacity: 0.85; margin-top: 4px; white-space: nowrap;">Third-Generation PCR Technology · 点击展开</div> </div> <div class="mw-collapsible-content"> <div style="padding: 25px; text-align: center; background-color: #f8fafc;"> <div style="display: inline-block; background: #ffffff; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 12px; padding: 20px; box-shadow: 0 4px 10px rgba(0,0,0,0.04);"> <div style="width: 140px; height: 90px; background-color: #f1f5f9; display: flex; align-items: center; justify-content: center; color: #94a3b8; font-size: 0.8em; padding: 10px; text-align: center;">Conceptual Model:<br>Sample Partitioning<br>20,000 Droplets</div> </div> <div style="font-size: 0.8em; color: #64748b; margin-top: 12px; font-weight: 600;">核心原理:分割-扩增-泊松统计</div> </div> <table style="width: 100%; border-spacing: 0; border-collapse: collapse; font-size: 0.85em;"> <tr> <th style="text-align: left; padding: 8px 12px; background-color: #f1f5f9; color: #475569; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; width: 40%;">技术代系</th> <td style="padding: 8px 12px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; color: #0f172a;">第三代 PCR</td> </tr> <tr> <th style="text-align: left; padding: 8px 12px; background-color: #f1f5f9; color: #475569; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">定量模式</th> <td style="padding: 8px 12px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; color: #1e40af;">[[绝对定量]] (Copies/µL)</td> </tr> <tr> <th style="text-align: left; padding: 8px 12px; background-color: #f1f5f9; color: #475569; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">检测下限 (LOD)</th> <td style="padding: 8px 12px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; color: #1e40af;">0.001% - 0.01% VAF</td> </tr> <tr> <th style="text-align: left; padding: 8px 12px; background-color: #f1f5f9; color: #475569; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">关键耗材</th> <td style="padding: 8px 12px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; color: #0f172a;">微滴生成油 / 芯片</td> </tr> <tr> <th style="text-align: left; padding: 8px 12px; background-color: #f1f5f9; color: #475569; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">核心优势</th> <td style="padding: 8px 12px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; color: #0f172a;">无需标准曲线 / 抗干扰</td> </tr> <tr> <th style="text-align: left; padding: 8px 12px; background-color: #f1f5f9; color: #475569;">主要应用</th> <td style="padding: 8px 12px; color: #1e40af;">[[液体活检]] / [[基因治疗QC]]</td> </tr> </table> </div> </div> <h2 style="background: #f1f5f9; color: #0f172a; padding: 10px 18px; border-radius: 0 6px 6px 0; font-size: 1.25em; margin-top: 40px; border-left: 6px solid #0f172a; font-weight: bold;">技术原理:数字化分割与泊松统计</h2> <p style="margin: 15px 0; text-align: justify;"> ddPCR 的工作流程可以概括为“分而治之,统计为王”,主要包含三个步骤: </p> <ul style="padding-left: 25px; color: #334155;"> <li style="margin-bottom: 12px;"><strong>微滴生成 (Droplet Generation):</strong> 利用油包水技术,将 20 µL 的 PCR 反应体系物理分割成约 20,000 个均一的纳升(nL)级微滴。根据概率论,此时稀有的靶分子被随机分配到这些微滴中,大多数微滴可能只含有 0 个或 1 个靶分子。</li> <li style="margin-bottom: 12px;"><strong>PCR 扩增 (Amplification):</strong> 微滴在普通 PCR 仪上进行热循环扩增。ddPCR 属于<strong>[[终点法PCR]]</strong>,不需要实时监测荧光,扩增结束后,含有靶分子的微滴发出强荧光(阳性,1),不含靶分子的微滴无荧光(阴性,0)。</li> <li style="margin-bottom: 12px;"><strong>信号读取与分析:</strong> 阅读仪逐个检测微滴的荧光信号。系统根据阳性微滴的比例,利用 <strong>[[泊松分布]]</strong> 公式 $P(x=0) = e^{-\lambda}$ 校正“多靶分子共处一滴”的概率,直接计算出样本中的起始拷贝数浓度。</li> </ul> <h2 style="background: #f1f5f9; color: #0f172a; padding: 10px 18px; border-radius: 0 6px 6px 0; font-size: 1.25em; margin-top: 40px; border-left: 6px solid #0f172a; font-weight: bold;">技术对比:qPCR vs. ddPCR</h2> <div style="overflow-x: auto; margin: 30px auto; max-width: 95%;"> <table style="width: 100%; border-collapse: collapse; border: 1.2px solid #cbd5e1; font-size: 0.92em; text-align: left;"> <tr style="background-color: #f8fafc; border-bottom: 2px solid #0f172a;"> <th style="padding: 12px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #0f172a; width: 20%;">特性维度</th> <th style="padding: 12px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #475569;">实时荧光定量 PCR (qPCR)</th> <th style="padding: 12px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #1e40af;">微滴数字 PCR (ddPCR)</th> </tr> <tr> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; font-weight: 600;">信号类型</td> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">模拟信号 (Analog) - 连续的荧光强度曲线 (Ct值)。</td> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">数字信号 (Digital) - 二进制的 0 和 1 计数。</td> </tr> <tr> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; font-weight: 600;">定量方式</td> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;"><strong>[[相对定量]]</strong>,必须依赖标准曲线,易受扩增效率影响。</td> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;"><strong>[[绝对定量]]</strong>,无需标准曲线,不受扩增效率微小波动的干扰。</td> </tr> <tr> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; font-weight: 600;">灵敏度</td> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">通常只能检测 >1% 的突变丰度,背景噪音高。</td> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">极高,可检测 <strong>0.001%</strong> 的痕量突变,适合液体活检。</td> </tr> <tr> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; font-weight: 600;">耐受性</td> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">对 PCR 抑制剂(如血液中的血红素)敏感。</td> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">高耐受性,因为数据基于终点判断而非反应速率。</td> </tr> </table> </div> <h2 style="background: #f1f5f9; color: #0f172a; padding: 10px 18px; border-radius: 0 6px 6px 0; font-size: 1.25em; margin-top: 40px; border-left: 6px solid #0f172a; font-weight: bold;">临床应用场景:精准定量的力量</h2> <p style="margin: 15px 0; text-align: justify;"> ddPCR 的高灵敏度和绝对定量特性使其在以下领域不可替代: </p> <ul style="padding-left: 25px; color: #334155;"> <li style="margin-bottom: 12px;"><strong>液体活检 (Liquid Biopsy):</strong> 监测血液中 <strong>[[ctDNA]]</strong> 的动态变化,用于肿瘤早筛、伴随诊断(如 EGFR T790M 检测)及 <strong>[[微小残留病]] (MRD)</strong> 的追踪。</li> <li style="margin-bottom: 12px;"><strong>拷贝数变异 (CNV) 分析:</strong> 能精确区分 2 拷贝与 3 拷贝的微小差异,常用于 HER2 扩增确证或 SMA 基因携带者筛查。</li> <li style="margin-bottom: 12px;"><strong>基因与细胞治疗质控:</strong> 准确测定病毒载体(如 <strong>[[AAV]]</strong>, Lentivirus)的滴度,或监测 CAR-T 细胞在体内的存续数量。</li> </ul> <h2 style="background: #f1f5f9; color: #0f172a; padding: 10px 18px; border-radius: 0 6px 6px 0; font-size: 1.25em; margin-top: 40px; border-left: 6px solid #0f172a; font-weight: bold;">关键相关概念</h2> <div style="background-color: #f8fafc; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 8px; padding: 15px; margin: 20px 0;"> <ul style="margin: 0; padding-left: 20px; color: #334155;"> <li style="margin-bottom: 8px;"><strong>[[微流控]] (Microfluidics):</strong> ddPCR 的物理基础,精确控制微小流体以生成尺寸均一的微滴。</li> <li style="margin-bottom: 8px;"><strong>[[泊松分布]] (Poisson Distribution):</strong> 解决“数字PCR并非只有0和1”问题的数学工具,校正多靶标重叠概率。</li> <li style="margin-bottom: 8px;"><strong>[[终点法PCR]] (End-point PCR):</strong> 与 qPCR 的实时检测不同,ddPCR 仅在扩增完全结束后进行一次性检测。</li> <li style="margin-bottom: 8px;"><strong>[[低频突变]]:</strong> 在大量野生型背景下存在的极少量突变 DNA,是 ddPCR 的主战场。</li> </ul> </div> <div style="font-size: 0.92em; line-height: 1.6; color: #1e293b; margin-top: 50px; border-top: 2.2px solid #0f172a; padding: 15px 25px; background-color: #f8fafc; border-radius: 0 0 10px 10px;"> <span style="color: #0f172a; font-weight: bold; font-size: 1.05em; display: inline-block; margin-bottom: 15px;">学术参考文献与权威点评 [Academic Review]</span> <p style="margin: 12px 0; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; padding-bottom: 10px;"> [1] <strong>Hindson BJ, et al. (2011).</strong> <em>High-throughput droplet digital PCR system for absolute quantitation of DNA copy number.</em> <strong>[[Analytical Chemistry]]</strong>. 83(22):8604-8610.<br> <span style="color: #475569;">[权威点评]:ddPCR 领域的奠基性论文,详细阐述了微滴生成系统的原理及其在 CNV 检测中优于 qPCR 的表现。</span> </p> <p style="margin: 12px 0; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; padding-bottom: 10px;"> [2] <strong>Vogelstein B, Kinzler KW. (1999).</strong> <em>Digital PCR.</em> <strong>[[PNAS]]</strong>. 96(16):9236-9241.<br> <span style="color: #475569;">[学术点评]:虽然早于 ddPCR 商业化,但这篇论文首次提出了“数字PCR”的概念,确立了通过稀释和分割将指数扩增转化为线性计数的核心思想。</span> </p> <p style="margin: 12px 0; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; padding-bottom: 10px;"> [3] <strong>Oxnard GR, et al. (2014).</strong> <em>Noninvasive detection of response and resistance in EGFR-mutant lung cancer using quantitative massive parallel sequencing of cell-free plasma DNA.</em> <strong>[[Clinical Cancer Research]]</strong>. 20(6):1698-1705.<br> <span style="color: #475569;">[学术点评]:临床转化应用典范,验证了 ddPCR 在肺癌患者血浆中检测 EGFR T790M 耐药突变的高灵敏度。</span> </p> </div> <div style="margin: 40px 0; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 8px; overflow: hidden; font-family: 'Helvetica Neue', Arial, sans-serif; font-size: 0.9em;"> <div style="background-color: #eff6ff; color: #1e40af; padding: 8px 15px; font-weight: bold; text-align: center; border-bottom: 1px solid #dbeafe;"> 微滴数字PCR · 知识图谱 </div> <table style="width: 100%; border-collapse: collapse; background-color: #ffffff;"> <tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"> <td style="width: 95px; background-color: #f8fafc; color: #334155; font-weight: 600; padding: 10px 12px; text-align: right; vertical-align: middle; white-space: nowrap;">上游技术</td> <td style="padding: 10px 15px; color: #334155;">[[PCR]]•[[微流控芯片]]•[[油包水乳化]]•[[荧光探针]]</td> </tr> <tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"> <td style="width: 95px; background-color: #f8fafc; color: #334155; font-weight: 600; padding: 10px 12px; text-align: right; vertical-align: middle; white-space: nowrap;">关键竞品</td> <td style="padding: 10px 15px; color: #334155;">[[qPCR]]•[[BEAMing技术]]•[[NGS]]•[[芯片数字PCR(cdPCR)]]</td> </tr> <tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"> <td style="width: 95px; background-color: #f8fafc; color: #334155; font-weight: 600; padding: 10px 12px; text-align: right; vertical-align: middle; white-space: nowrap;">临床关联</td> <td style="padding: 10px 15px; color: #334155;">[[NIPT]]•[[病原微生物检测]]•[[环境监测]]•[[Bio-Rad]]</td> </tr> <tr> <td style="width: 95px; background-color: #f8fafc; color: #334155; font-weight: 600; padding: 10px 12px; text-align: right; vertical-align: middle; white-space: nowrap;">数据统计</td> <td style="padding: 10px 15px; color: #334155;">[[泊松分布]]•[[置信区间]]•[[阈值设定]]•[[拷贝数浓度]]</td> </tr> </table> </div> </div>
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