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科学家构建新的生命树
...领构建了一个开放获取的系统发生树，于去年发表，这个系统树将现有的分支整合在一起，构建了一个包括230万种生物的分支，其中几乎没有微生物。他告诉TheScientist杂志：“如果你对生命之树感兴趣，这正是你想看到的，因为...
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利用系统表型学构建出有胎盘类动物的共同祖先
...种是DNA所编码的基因数据。一些学者认为，构建强有力的系统树需要整合两种类型的数据，因为无论是基因数据还是表型数据，单一采用任何一种都会遗漏另外一类有效信息。研究有胎盘类动物的演化历史就是一个例子，分析的...
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与糖尿病脂类相关的酶
...究小组利用公开已知的核苷酸序列描绘出了25个BChE基因的系统树；建立系统树时同时用到了距离法和最大简约法。两种方法得出的树状图相似，只是Susscrofa（M62778）和Oryctolaguscuniculus（M62779）的位置是颠倒的。尽管比不上已知功...
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利用第二代测序仪测定铁竹线粒体基因组
...严重冲突。进一步的分析表明，这一冲突可能是由线粒体系统树中的长枝吸引所造成的。基于所构建的系统树，探讨了禾本科线粒体基因组序列的进化速率在进化历史中的变化，发现在禾本科分化之前其线粒体基因组序列有着相...
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昆明植物所探索解决温带木本竹子系统发育关系的SNP标记
...发育树，MP分析、ML分析及BI分析均产生了拓扑结构一致的系统树。在该系统树中，冷箭竹的2个居群聚为一支且得到了100%的支持率。为进一步检验RAD测序在温带木本竹子系统发育树构建中数据利用的效率，研究人员设置了不同大...
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我国口岸出入境人员HIV-1基因亚型分析*
...果2004～2006年确认的39例HIV阳性标本，根据gag区基因序列系统树分析显示，共有8种亚型，其中12例C亚型，9例CRF01_AE重组，6例CRF07_BC重组，5例CRF08_BC重组，4例B亚型，1例B’亚型，1例CRF02_AG重组和1例A1亚型。结论北京口岸检出的HIV-1...
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福建省HIV-l流行毒株的基因序列测定和亚型分析
...用Distances计算一组序列间的基因离散率；用Grouptree程序做系统树(phylogenetictree)分析。结果 经nested-PCR扩增后，从9份HIV-l阳性者PBMCs样品中获得可用于序列测定的HIV-1env基因的目的片段。由env-D3和env-f2引物所得测序结果进行编辑...
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青海省1999年脊髓灰质炎Ⅰ型野毒株的分子病毒学分析
...R：Myanmar。地区后的两位数字代表毒株流行年份。 4 系统树分析 用NeighborJoin和BootstrapTest方法作基因序列亲源关系系统树如图3。3 基因序列亲源关系系统树注：C／CHN：CHINA；QH：Qinghai；IRA：Iran； IND：India；PAK：Pakistan...
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郁文彬等研究构建斗叶组系统演化关系
...争论。郁文彬告诉记者，他们的研究显示核基因ITS构建的系统树、网状结构图与传统分类具有较高的一致性。同时，叶绿体联合分析显示，四川分布的拟斗叶马先蒿两个居群的叶绿体基因组可能是从斗叶马先蒿的祖先中捕获而来...
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HIV-1抗体阳性血浆中HIV-1病毒基因分型研究
...)同时进行测序反应。在ALF全自动DNA测序仪上测序。应用系统树分类方法进行HIV-1亚型分型分析[5]。 2 结果 2.1 血清学分析 6份血浆标本用芬兰Labsystems和本室制备的抗HIV-1/2ELISA试剂检测为抗HIV-1阳性。进一步用美国BIOR...
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1995年大连麻疹病毒流行株的部分基因分析
...件Megalign程序，依据N基因1235～1516nt核酸序列差异做序列系统树。 结 果 1.用RT-PCR法，疫苗株和患者标本均扩增得到N基因318bp、M基因188bp核酸片段。阴性对照则无此片段(照片略)。 2.对疫苗株和两个标本的M基因152nt的...
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重庆市HIV-1流行毒株的基因序列测定和亚型分析
...并得到相应序列，扩增率为67.6%。经过基因离散率计算和系统树分析后证实:1份标本为CRF01-AE流行重组毒株，20份标本为HIV-1BC重组毒株。可见目前重庆市HIV-1BC重组病毒为优势流行株，为有效控制HIV流行，需要重点在吸毒人群中开...
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上海辰山植物园发现秋海棠新种
...紫背天葵，但其根茎苞片多毛且上部开裂、花期晚。分子系统树的结果也将本种与其他近缘种明显分开，研究人员将其定位到秋海棠组。据专家介绍，秋海棠属是全球植物多样性最丰富的类群之一，为被子植物第六大属，已知近...
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世界上首次解码颚口线虫线粒体基因组
...基因构建了多种动植物线虫的系统发育树。基于所构建的系统树，本研究还探讨了颚口下目在线虫纲中的位置，发现颚口下目与蛔虫下目亲缘关系最近。该团队在澳大利亚墨尔本大学、深圳华大基因（BGI）等国内外有关单位的支...
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年轻院士最新文章解析骨骼基因
...和啮齿类的进化，在国际上建立了较为全面的熊超科分子系统树等。直立行走是人类区别于猿类的重要特征，同时，现代人类也具有很高的表型多样性。这些形态的差异很大部分是由骨骼系统塑造而成的。例如不同人群在体型、...
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霸王恐龙与现代鸟类具有共同祖先
...子数据，将非鸟类的恐龙列入用于跟踪物种的进化的生命系统树中。 阿萨拉参与了新的研究工作，他表示：“我们确信，事实上将霸王龙归类于鸵鸟和鸡等鸟类动物，比将其归类与我们研究的其它生物更合适。我们同时还认...
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中毒性表皮坏死松解症伴发林生地霉感染一例
...，在基因库核酸序列数据库中进行同源序列搜索，并通过系统树显示亲缘关系。结果患者左手背脓液直接镜检，可见大量孢子和少量透明菌丝。连续3次血、尿真菌培养，均有形态一致的白色菌落生长，皮损分泌物培养阴性，联...
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中药葛根及其近缘种的rDNA－ITS序列分析
...性则分别达到8.14％和12.82％以上。根据ITS序列特征构建的系统树，不同产地的野葛首先聚类，然后与粉葛聚在一起，山葛最后聚类。 结论：根据分子性状特征，粉葛作为野葛的变种，山葛独立成种较为合理。ITS序列特征是中...
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生物从咸水迁移到淡水引起物种分化
...和咸水中分布的115种钩虾为研究对象，通过基因序列构建系统树，首次提出淡水钩虾起源于古地中海，并在4300万年前（始新世）由咸水迁移到淡水。原来在咸水中生活的钩虾物种分化缓慢，进入淡水环境后进化速度却经历了早...
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研究称用病毒芯片可鉴别新病毒
...著的、非预期的与RTI相关病毒的差异，并确定了人鼻病毒系统树的全新分支，这也是普通感冒病毒的致病因素之一。Kistler说，这表明即使只有很少的样本，病毒芯片也可以检测出不能培养出的新型病毒。研究人员还检测出了30个...
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昆明动物所科学家揭示了东亚野猪和家猪的进化
...具有广泛代表性的东亚家猪和野猪的系统发育关系树。该系统树为进一步归类划分东亚野猪和家猪mtDNA世系提供了依据和蓝图。基于建立的这一系统，该小组描绘出高分辨率的东亚家猪和野猪mtDNA系统发育地理图，推断出东亚野...
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中国动物学家成功揭示鸡形目所属生物系统发育关系
...了鸡形目34个种的线粒体全基因组，得到了支持率较高的系统树，为澄清鸡形目，特别是雉科长期混淆不清的系统发育关系提供了重要的证据。研究结果显示，传统上根据形态等划分的雉类、鹑类、孔雀类以及角雉类都不是单系...
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昆明植物所完成六种木本竹子叶绿体基因组全序列的测定
...对系统关系的影响，研究组分别利用了四组数据分别构建系统树。分析表明，基于叶绿体基因组全序列的系统发育分析结果较为理想。对基因中插入或缺失的研究，发现45个插入或缺失中有25个可能为共近裔性状，20个可能为平行...
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科学家提出酪氨酸丢失新假说
...达谱的分化、基因组及蛋白质组的进化和分子进化和分子系统树的构建等诸多领域，取得重要研究成果。曾发表了100余篇学术论文，包括著名学术刊物Nature,NatureGenetics,PNAS等，总引用达2500多次（数据来自千人计划网）。后生动物...
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昆明植物所竹亚科青篱竹族的系统发育和进化研究获进展
...分支比叶绿体片段具有更好的分辨率，但叶绿体和核基因系统树存在冲突（见图），一方面可能是由于信息位点不足造成的，另一方面可能由不完全谱系分选、杂交和基因渐渗引起。此外，结合分子系统学、形态学、细胞学和地...
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科学家完成绝大多数担子菌酵母已知种的多基因序列分析
...rankboundaryoptimization)和GMYC(generalmixedYulecoalescent)等，对根据系统树界定的目、科和属进行了量化评估，以检验各个等级分类单元界定的合理性。再结合形态和生理生化等表型特征，并遵循“一种真菌一个名称”的新命名法规，白逢...
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科学家发现曾祖父级血细胞可生长为任意血细胞
...人类血细胞的“曾祖父”，这项研究填补了人类血液细胞系统树的空白，并可能给血细胞生成技术，血癌等血液病治疗技术带来新希望。论文发表于12月13日的《干细胞》杂志上。 美国斯坦福干细胞生物学与再生药研究所主...
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分子古生物学的突破性进展
...列上留下了不可磨灭的烙印；根据现生生物DNA序列建立的系统树，不仅可用于独立验证以化石资料为依据的系统分析，而且，它与可靠的化石记录一起，可计算生物的演化速率。这一研究方法提供了一种新的不单纯依赖地层记录...
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探索水生生物多样性“迷踪”
...了美国自然基金会“生命之树”项目，构建鲤科、鳅超科系统树。“通过分子生物学方法进行分析，发现我国很多鱼类物种分化处在比较早期，非常活跃。”刘焕章认为，实验室在分子生物学研究方面有很多重要进展，仪器、手...
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张亚平院士：生物多样性研究先锋
...和啮齿类的进化，在国际上建立了较为全面的熊超科分子系统树；探讨了亚洲人群的源流与迁移分化，证实全世界的狗具有相同的遗传基础起源于东亚，之后才逐渐扩散到世界各地；系统地研究了我国许多濒危和非濒危物种的遗...