5 分类类型
属
7 甲病毒属成员
种 | 型 |
奥拉病毒(Aura virus) | |
巴马森林病毒(Barmah Forest virus) | |
比巴鲁病毒(Bebaru virus) | |
卡巴斯欧病毒(Cabassou virus) | |
基孔肯雅病毒(Chikungunya virus) | |
东方马脑炎病毒(Eastern equine encephalitis virus) | |
沼泽地病毒(Everglades virus) | |
摩根堡病毒(Fort Morgan virus) | 博吉河病毒(Buggy Creek virus) |
盖塔病毒(Getah virus) | |
高地J病毒(Highlands J virus) | |
马亚罗病毒(Mayaro virus) | |
米德尔堡病毒 (Middelburg virus) | |
莫斯达斯佩德拉斯病毒(Mosso das Pedras virus) | |
穆坎布病毒 (Mucambo virus) | |
恩杜穆病毒(Ndumu virus) | |
欧尼恩病毒(O’nyong-nyong virus) | |
那皮舒纳病毒(Pixuna virus) | |
里奥内格罗病毒(Rio Negro virus) | 里奥内格罗病毒Ag80-663株(Rio Negro virus-Ag80-663) |
罗斯河病毒(Ross River virus) | |
鲑鱼胰腺病病毒(Salmon pancreas disease virus) | 嗜睡症病毒(Sleeping disease virus) |
西门利启森林病毒(Semliki Forest virus) | |
辛德比斯病毒(Sindbis virus) | 巴班肯病毒(Babanki) |
孜拉加奇病毒(Kyzylagach) | |
奥克尔布病毒(Ockelbo) | |
南方象海豹病毒(Southern elephant seal virus) | |
图那特病毒(Tonate virus) | |
特罗卡拉病毒(Trocara virus) | |
乌纳病毒(Una virus) | |
委内瑞拉马脑炎病毒(Venezuelan equine encephalitis virus) | |
西方马脑炎病毒(Western equine encephalitis virus) | |
瓦塔罗阿病毒(Whataroa virus) |
8 甲病毒属基本特性
甲病毒属成员基因组长度为11-12kb,基因组5’端有m7G通过5’-5’三磷酸与A相连,在A上缺少核糖甲基化,因此甲病毒5’端为O型帽子结构。病毒基因组3’端带有poly(A)尾,但比真核生物mRNA的3’端poly(A)尾短,平均长度70bp。甲病毒RNA的感染性需要3’端poly(A)尾的存在,,一些病毒基因组缺少poly(A)尾则没有感染性。
甲病毒基因组(49S RNA)既可作为mRNA翻译合成非结构蛋白(nsPs),也可作为复制的模板合成负链RNA,负链RNA又是新的病毒基因组和26S亚基因组RNA合成的模板。病毒基因组RNA的翻译从靠近其5’端的单一AUG起始,一直延伸到病毒基因组2/3处的3个终止密码子,3个终止密码子恰好在亚基因组转录起始点的下游。合成的多聚蛋白经过翻译后切割,生成4种特定的多肽,分别称为nsP1、nsP2、nsP3和nsP4,其中nsP2的C端有蛋白酶活性,N端与细菌解旋酶同源;nsP1具有甲基转移酶活性,与负链RNA合成有关;nsP4是一种病毒聚合酶,含有许多病毒RNA聚合酶所共有的GDD基序。