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首届世界华人计算生物和分子模拟大会举行
...分子反应动力学国家重点实验室以及理论计算中心主办，分子模拟与设计研究组(1106组)承办的第一届世界华人计算生物和分子模拟大会在大连化物所举行。来自海内外的理论与计算化学、计算生物学等相关领域的专家、学者100余...
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计算生物学成为现代生物学研究的核心方法之一
...科学研究、技术开发和工程设计中必不可少的重要基石。分子模拟和辅助药物设计是研究热点与会专家指出，在新药研发方面，能够利用高性能计算机实现活性化合物的虚拟筛选，并从筛选的活性化合物出发进行靶点的发现与确...
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galE变异株及亲代株空肠弯曲菌诱导动物外周神经损伤的对比研究
...周神经损伤的关键结构，为CJ感染相关格林-巴利综合征的分子模拟理论提供动物实验证据，研究者将32只豚鼠随机分为亲代株组(10只)、变异株组(10只)、对照组(6只)、PBS组(6只)，分别用亲代株及弗氏佐剂、galE变异株及弗氏佐剂、P...
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S1P调控机制研究取得重大进展
...奠定了基础。在该研究中，上海药物研究所研究人员利用分子模拟方法预测组蛋白去乙酰化酶(HDAC)可能是S1P的作用靶标，并预测了两者间的结合模式和关键作用残基，进而精确预测出S1P与HDAC的亲合能力与HDAC现有抑制剂SAHA相当。...
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乙型肝炎病毒与自身免疫病的关系
...与自身免疫病发病关系密切[1，2]，其机制可能是HBV通过分子模拟、Bystandereffects(旁观者效应)、抗原表位扩增、刺激非免疫细胞表达MHC分子等诱发产生自身抗体和激活自身反应性T淋巴细胞导致自身免疫病的发生。HBV在自身免疫性...
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自身免疫性肝炎
...系，具体的发病机制现在还不完全清楚。最主要的解释是分子模拟假说［5］，外来抗原通过分子模拟自身抗原可能是免疫耐受缺失的最主要原因，但这种机制在人类中还没有被证实。人们推测一些细菌（大肠杆菌、金黄色葡萄...
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自身抗原SSB/La抗原优势表位分析
...的工具。自身抗体的产生可能有多克隆B细胞激活、自身分子模拟等机制参与。已有证据表明，在一些自身抗体反应中有多克隆B细胞的激活，而用重组核抗原的研究又提示ANA反应由自身抗原诱导和维持［1］。在自身免疫性心肌炎...
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类风湿关节炎的主要病因探讨
...细胞，对与HSP分子相似的关节软骨蛋白多糖起反应，通过分子模拟机制引起关节炎。2遗传RA的发病与遗传有关［4］。与RA患者有血缘关系者的患病率为无血缘者的3.6倍。同卵双生儿中RA患病一致率为30%，远高于异卵双生的7%。在RA...
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973计划“抗体分子结构与功能进化研究”项目通过课题验收
...或抗体-抗原复合物的晶体结构；利用生物信息学工具和分子模拟平台对抗体多样性产生规律、结合位点预测等方面进行了深入研究。项目顺利完成了五年的计划任务，达到了预期目标，取得的原创性成果为阐述抗体分子结构与...
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药物分子设计成为药物研究核心技术
...子设计方法。进入上一世纪90年代，药物分子设计（包括分子模拟和计算机辅助药物分子设计）已作为一种实用化工具介入到药物研究的各个环节。 目前，美、英、日、德、法等许多发达国家都有一批著名科学家领导的研究组...
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智利开发出可用于癌症诊断的新型纳米材料
...症的早期诊断。 据参与研究的塔尔卡大学生物信息与分子模拟中心主任冈萨雷斯·尼罗介绍，这种新型纳米复合材料能够识别、标记癌细胞分子，从而使癌症早期诊断更加有效；此外，这种纳米复合材料还可将抗癌药物直接...
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我国开发出口服治疗糖尿病小分子
...的明显优势在于口服即有效。该刊评价说，通过非肽类小分子模拟人体内的肽类大分子激素调节血糖，实现了糖尿病治疗领域的一大突破。此前获准上市的一种糖尿病治疗药物Exenatide也属于这种多肽类似物，虽然在治疗成年人Ⅱ...
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药物所组合化学集中库设计与优化方法获专利
...过程。在这个过程中，计算机早已成为不可缺少的手段，分子模拟、组合化学、构效关系以及数据挖掘等领域都是计算机大显身手的地方。利用计算机采用各种可能的方法，搜寻和优化先导化合物，提高其理化指标和生物活性，...
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药物研究中的分子识别
...法第二章分子识别的计算机模拟与药物设计一、前言二、分子模拟与计算方法三、基本受体结构的药物分子设计四、三维定量构效关系第三章反义核酸的分子识别与药物设计一、以核酸为靶的药物研究进展概况二、反义RNA（asRNA...
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科学家在DNA折纸单分子反应中发现“穿越”
...呈现纳米网格结构，网格的孔洞呈现规则而有序的排列。分子模拟与原子力显微镜检测结果显示，这些“纳米孔的孔径约在1至3纳米间，尺度合适的单链DNA分子可穿过“纳米孔。通过巧妙的图案化设计和单分子识别反应的...
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上海应物所等在DNA折纸单分子反应中发现分子穿越现象
...纳米网格结构，网格的孔洞呈现规则而有序的排列，通过分子模拟与原子力显微镜检测结果显示，这些“纳米孔”的孔径约在1-3纳米间，由此，尺度合适的单链DNA分子，可以穿过“纳米孔”。通过巧妙的图案化设计和单分子识别...
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南方医科大学免疫学（博士）试题2005年
...2005年博士研究生入学考试试题1异嗜性抗原膜攻击复合体分子模拟细胞因子共刺激因子粘附分子模式识别受体SmIgHLAWestenbloting2\免疫的现代概念是什么？如何理解它的双重性？3.细胞因子的共同特征？有哪些主要的生物学特征？4.CD...
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研究发现艾滋病毒Tat蛋白一全新高亲和力肝素结合位点
...研究结果发表在PLoSONE杂志2008年第7期上。该研究以计算机分子模拟为指引，借助分子生物学和生物芯片技术，首次发现了Tat蛋白上一个全新的由Lys12，Lys41，Arg78组成的空间三联体、高亲和力肝素结合位点(KKR区)，这是继Tat蛋白已...
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上海药物所双氢青蒿素增溶技术研究获进展
...系统后，其水溶性和溶液稳定性显著提高。该研究还通过分子模拟技术和固态表征方法，证明了三元复合物的形成，并对双氢青蒿素、环糊精和磷脂间的相互作用进行了分析和解释，提出三者之间存在的疏水作用、氢键等分子间...
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研究人员开发首个DNA模拟平台
...分子系统，从几纳米到一米。巴塞罗那生物医学研究所，分子模拟和生物信息学实验室的莫德斯托奥罗斯科正在领导一项研究，通过开发几种理论方法，在更大的时空尺度上并专注于生物医学与生物技术应用热点，来更好地了解...
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生物合理设计绿色农药的分子基础研究取得重要进展
...分子如嘧啶水杨酸类除草剂的药效构象分析。此外，通过分子模拟技术发现了芳氧苯氧羧酸以及环己二酮类除草剂与靶酶之间存在一个新的重叠结合位点（Ser-698）。 4.在农药活性化合物的设计与合成方面，合成了10类共计800...
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结合了毒素的益生菌可能用来防治感染性腹泻
...希杆菌引起的感染性腹泻。这种重组有机物的特点是表面分子模拟了能结合细菌毒素的宿主细胞受体，因此能结合这些毒素，并防止它们损害肠细胞。阿德莱德大学的帕顿（JamesC.Paton）和同事创建这种益生菌是为结合大肠埃希杆...
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复旦大学“绘出”艾滋病关键酶结构
...解其完整结构。 据唐赟介绍，通过“计算生物学”中分子模拟的方法，其得到了“IN”全长蛋白质及其病毒和人类DNA形成复合物的结构模型。这些结构模型能够展示出“IN”是如何与艾滋病毒还有人类DNA进行相互作用的。唐...
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HIV的gp120外壳蛋白的结构研究
通过低温电子断层扫描术和分子模拟方法研究了HIV的gp120外壳蛋白的结构。将gp120在一种非结合状态的结构、在与一种中和性抗体结合在一起的状态的结构和在与CD4细胞表面蛋白结合在一起的状态的结构所做的对比，为了解发生...
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台湾成大启动生医整合计划研究纳米技术危险性
...经传导物质、DNA、疾病性蛋白质、免疫细胞的影响，进行分子模拟实验。 成大表示，台湾纳米产业产值去年已逾新台币3000亿元，但纳米科技安全性仍未获得证实。成大预定10月完成第1阶段实验成果，11月在台举办研讨会时发...
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我国开发出口服治疗糖尿病小分子有望找到糖尿病及其他代谢性疾病新疗法
...的明显优势在于口服即有效。该刊评价说，通过非肽类小分子模拟人体内的肽类大分子激素调节血糖，实现了糖尿病治疗领域的一大突破。此前获准上市的一种糖尿病治疗药物Exenatide也属于这种多肽类似物，虽然在治疗成年人Ⅱ...
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上海应物所等在气体生物麻醉效应分子机理研究中获进展
...研究所水科学与技术研究室的方海平课题组与合作者运用分子模拟手段，发现氮气分子可以类似气泡的聚集体阻碍蛋白的正常生理功能。该研究为从分子机制理解气体的生物麻醉效应提供了崭新的思路，同时也为气体麻醉剂在临...
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计算生物学所泛素多聚体折叠中间体性质合作研究获进展
...院计算生物学所研究组长FraukeGraeter博士和夏飞博士利用分子模拟的方法，理论研究了泛素多聚体折叠过程以及中间体的性质，并提出多聚体中单体间的相互作用将导致中间体的产生，而这些稳定的中间体通过两个相邻单体间交...
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天津工生所建立高效合成2-脱氧D-核糖全细胞催化技术
...肺炎克雷伯杆菌（Klebsiellapneumonia）的DERA为出发酶，通过分子模拟和定点突变的策略，提高其针对非磷酸化小分子底物的活性和耐受性，获得的突变体其酶活性提高3.2倍，底物耐受性提高1.5倍；通过采用全细胞催化策略，产物得...
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上海药物所葡萄糖激酶催化机制研究取得进展
...方法，对葡萄糖催化的机制进行了深入系统的研究。采用分子模拟和分子动力学方法在构建了葡萄糖激酶-ATP-葡萄糖三元复合物的三维结构，获得了精确的葡萄糖激酶的催化反应环境，发现了与葡萄糖激酶催化活性密切相关的一...