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新碱基随基因组变化谱出炉
...芝加哥大学研究人员合作，绘制出了小鼠大脑中5-羟甲基胞嘧啶（5-hmC）的图谱，显示出该碱基从发育到老化的生命过程中随基因组变化而变化的分布方式。相关论文发表在《自然·神经系统科学》杂志网站上。此前的研究认为，...
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伊成器研究组在NatureMethods发表论文报道5-醛基胞嘧啶测序新技术
fC-CET检测全基因组5-醛基胞嘧啶修饰谱图（a）化合物AI标记5-醛基胞嘧啶；（b）fC-CET流程图；（c，d）5-羟甲基胞嘧啶（c）及5-醛基胞嘧啶（d）标记位点胞嘧啶的表观遗传修饰情况，显示5fC标记的位点整体甲基化比例极低。2015年9...
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宋洪军《cell》文章：解析DNA去甲基化机制
...章中研究人员首先利用几种不同的化合物诱导细胞DNA上的胞嘧啶（C）发生甲基化改变，并在随后观察了甲基化胞嘧啶（mC）的变化。在两天里，研究人员并未观察到发生任何改变，然而当他们将一种称为TET1的蛋白添加到细胞中...
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生化与细胞所揭示尿嘧啶脱羧酶的催化机制
...参与了DNA的主动去甲基化过程，该蛋白催化产生的5-羧基胞嘧啶可能通过两种途径被转变为胞嘧啶，其中一种途径就是通过潜在的DNA脱羧酶直接催化5-羧基胞嘧啶发生脱羧反应。由于胞嘧啶和尿嘧啶的化学结构和性质比较相似，...
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能帮助干细胞保持其多能性的蛋白质
...并提供了蛋白质的首个基因组内的位置及其产物-5-羟甲基胞嘧啶，被称为DNA的\第六个碱基\的基因组。主持该项研究的UNC大学生物化学家YiZhang博士认为该发现是理解细胞分化及癌症发展背后的分子机制的一大重要步骤，目前已刊...
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上海药物所表观遗传分子机制合作研究取得新进展
...啶碱基的分子机制。TDG能选择性剪切由TET蛋白催化5-甲基胞嘧啶（5mC）氧化产生的5-醛基胞嘧啶（5fC）及5-羧基胞嘧啶（5caC），继而启动下游DNA剪切修复（BER，base-excisionrepair）通路，将5mC还原成未修饰的胞嘧啶。然而，TDG如何在...
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胸腺嘧啶DNA糖基化酶作用机制
...良研究员等。在高等生物中比较普遍的DNA修饰方式主要是胞嘧啶甲基化，生成5-甲基胞嘧啶（5-methylcytosine，5mC），这一过程可以通过Tet家族双加氧酶（dioxygenases），转化成另外一种修饰形式：5-羟甲基胞嘧啶（5-hydroxymethylcytosine...
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Nature：5-羟甲基胞嘧啶在基因组中的分布
...医院等机构的研究人员开发出两种方法，来分析5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）的基因组定位。该研究成果近日发表在《Nature》在线版上。5-羟甲基胞嘧啶是一种修饰的碱基，以低水平存在于哺乳动物的多种细胞类型中。5hmC是TET家族的酶...
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细菌细胞DNA中碱基成分的高效液相色谱测定法的研究
...。本文对高效液相色谱测定DNA中碱基成分鸟嘌呤（G）、胞嘧啶（C）、胸腺嘧啶（T）、腺嘌呤（A）的方法进行了研究，对部分细菌细胞DNA中的碱基成分进行了测定，现报告如下。1实验部分1.1仪器及工作参数HP1100LC液相色谱仪，HP...
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Cell：何川等表观遗传学新文章
...研究人员，近日在小鼠小鼠胚胎干细胞(mESCs)中绘制出了5-胞嘧啶甲酰（5-formylcytosine，5fC）的全基因组分布模式图谱。这一突破性研究成果发表在4月18日的《细胞》（Cell）杂志上。来自加州大学的著名华人科学家何川（ChuanHe）教...
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科学家确定DNA第7种和第8种碱基
...为DNA中只包含有4种碱基：腺嘌呤、鸟嘌呤、胸腺嘧啶和胞嘧啶，这4种碱基已成为我们对基因代码如何形成生命的认识的基础。然而不久前，科学家们将碱基的数量扩展到了6种（第5种碱基：5-胞嘧啶甲基，第6种碱基：5-胞嘧啶甲...
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活性DNA去甲基化的历史
在大多数真核生物基因组中，DNA胞嘧啶甲基化（5-甲基胞嘧啶）是一种常见的非基因影响引起的修饰，它广泛存在于植物和脊椎动物细胞的有丝分裂过程中，通过一些未知的机制使启动子甲基化富集引起了强的转录抑制。转座子...
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DNA甲基化与肿瘤
【摘要】DNA甲基化是指由DNA甲基转移酶介导，在胞嘧啶(C)的第五位碳原子上加上一甲基基团，使之变成5-甲基胞嘧啶(5-mC)的化学修饰过程。DNA甲基化作用的发生和甲基化水平的高低主要取决于DNA甲基化酶。涉及到个体的发育、细...
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第七种碱基5fC在基因组中的分布
...大学的研究人员绘制了第一张小鼠胚胎干细胞中5-甲酰基胞嘧啶（5fC）的基因组分布图，并评估了5fC在分化中的可能作用。该研究成果于8月17日发表在《GenomeBiology》上。近几年，科学家的研究重心从4种基本碱基逐渐转移到其他...
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揭开癌症遗传学之谜
...的要求。 通常来说，DNA甲基化发生在DNA启动子区域的胞嘧啶残基上，尤其是在CpG岛上，绝大多数正常细胞中的基因是不会形成甲基化胞嘧啶核苷酸的，目前认为CpG岛甲基化导致转录抑制是恶性肿瘤发生的重要机制之一，细胞...
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揭开癌症揭开癌症遗传学之谜
...的要求。 通常来说，DNA甲基化发生在DNA启动子区域的胞嘧啶残基上，尤其是在CpG岛上，绝大多数正常细胞中的基因是不会形成甲基化胞嘧啶核苷酸的，目前认为CpG岛甲基化导致转录抑制是恶性肿瘤发生的重要机制之一，细胞...
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2009年最值得关注的技术：甲基化检测
除了ATGC这四种碱基，人们对第五种碱基-甲基化的胞嘧啶的兴趣也日益增加。甲基化修饰的存在对DNA转录的调控起了重要作用，异常的甲基化往往是许多疾病的起因。既然如此重要，系统绘制甲基化组的方法自然也多了起来。甲...
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复旦大学Cell子刊发表最新研究成果
...基化修饰的功能还知之甚少。Tet1是一种能够催化甲基化胞嘧啶(5mC)成为羟甲基化胞嘧啶(5hmC)的酶，在小鼠胚胎干细胞中高表达。在施扬和石雨江两位教授的领导下，复旦大学生物医学研究院表观遗传学实验室与哈佛医学院的研究...
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核苷突变如何混入DNA复制
...一些核苷进行相互连接。其中的四个核苷分别是鸟嘌呤、胞嘧啶、腺嘌呤和胸腺嘧啶，在正常DNA中，鸟嘌呤和胞嘧啶配对，腺嘌呤和胸腺嘧啶配对。然而，游离的活性氧化基团可以将鸟嘌呤变成“8-氧基－鸟嘌呤”，这个过程会...
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何川教授：第六种碱基的奥秘
...的技术，生物通特联系了何川教授并请教了他。5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）数十年前就知道，哺乳动物DNA胞嘧啶碱基有两种修饰：5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶。在这些年里，5-mC得到广泛的研究，作为一种稳定且重要的表遗传修饰...
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生态环境中心发现维生素C可调控甲基化DNA氧化的新功能
...Vc可显著增强DNA羟化酶Tet（teneleventranslocation）氧化5-甲基胞嘧啶的活性，进而促进DNA去甲基化作用。其相关研究成果以全文形式发表在国际化学期刊《美国化学会志》（J.Am.Chem.Soc.2013,315:10396-403）上。DNA甲基化是哺乳动物体内一...
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徐彦辉等《自然》揭示TET蛋白底物偏好性机制
...化衍生物不同催化活性的分子机制，为基因组中5-羟甲基胞嘧啶相对稳定存在提供了分子水平的解释。该论文是徐彦辉课题组在DNA甲基化领域作出的又一突破性成果。组长徐彦辉为复旦大学生物医学研究院研究员，复旦大学附属...
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Cell：张毅发布表观遗传学重要成果
...校的研究人员，在新研究中绘制出了一张全基因组5-甲基胞嘧啶(5mC)氧化动态图谱，并证实TET/TDG依赖性的活性DNA去甲基化过程广泛存在于哺乳动物基因组中。这一重要的研究成果在线发表在4月18日的《细胞》（Cell）杂志上。著名...
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动物所等异常表观修饰参与亨廷顿舞蹈病病理研究获进展
亨廷顿氏舞蹈病模型小鼠的脑组织具有显著降低的胞嘧啶羟甲基化水平亨廷顿氏舞蹈病是一种常染色体显性遗传的神经退行性疾病，其主要病理特征是大脑纹状体神经元的渐进性死亡。亨廷顿基因突变导致纹状体神经元选择性死...
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Science解读甲基化组新观点
在真核生物中，DNA甲基化通常发生在CG中的胞嘧啶上。由于甲基化不会改变DNA序列，它被视为一种表观遗传学标志。DNA甲基化可以在细胞分裂过程中延续到子代细胞，这一机制现在已经相当明确。而这种继承性使DNA甲基化成为储...
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董晨、魏来教授Cell子刊发表免疫研究新成果
...魏来教授。这项研究显示，Tfh细胞中的Bcl6结合与5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）减少密切相关。Bcl6和STAT5靶标同样的结合位点，通过抑制IL-7R/STAT5通路促进Tfh细胞的分化。这些发现为人们提供了新的线索，有助于进一步理解Bcl6在Tfh细胞...
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女院士《Nature》破解iPS瓶颈DNA去甲基化问题
...基因表达。在甲基转移酶的催化下，DNA的CG两个核苷酸的胞嘧啶被选择性地添加甲基，形成5－甲基胞嘧啶，这常见于基因的5‘-CG-3‘序列。大多数脊椎动物基因组DNA都有少量的甲基化胞嘧啶，主要集中在基因5＇端的非编码区，...
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脂肪组织源性干细胞可传递靶向癌症基因治疗
...及其同事研究了人AT-MSC作为使用5-氟尿嘧啶(5-FU)前药5-氟胞嘧啶(5-FC)靶向化疗的基于细胞的基因导向性酶前体药物疗法的运载工具。作者报告，在体外，人结肠腺癌细胞(HT-29)和它们的无细胞培养基刺激AT-MSC定向迁移。使用胞嘧啶...
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科学家解析基因组及转录组中新发现突变
...也定义了高等生物中的细胞状态，比如DNA中发现的5-甲基胞嘧啶（5-mC），就是真核生物表观遗传修饰中近期才解析的核苷酸变异。但是研究表示，5-mC只是DNA表观遗传动态调控网络的一个小成员，这一调控网络还包括5-羟甲基胞嘧...
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宋红军、金鹏教授Cell子刊发布表观遗传惊人发现
...Tet1是一个活跃的5mC羟化酶，具备在体内、体外羟化5-甲基胞嘧啶（5mC），为5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）的活性，从而启动DNA去甲基化过程，使得DNA甲基化介导的基因沉默重新激活。另一方面，Tet1蛋白本身还具有将5hmC进一步催化为5-...