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系统方法
系统方法指运用系统科学的原理将事物作为一个系统进行考察和调节的方法。从根本上突破了传统的把整体分解开来研究之后用部分去说明整体的分析、还原方法的局限性，要求对影响系统整体性能的各有关方面进行全面的考察和调节，包括要素的性能、要素与要素的关系、要素与系统的关系、系统与环境的关系等；
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层次序列
层次序列指系统的结构层次按一定内容或方向呈现的有序性排列。现代科学和哲学把整个物质世界理解为一个庞大的层次序列：总星系一星系团—银河系—太阳—地球—生物圈—社会—人—器官—组织—细胞—细胞器—分子—原子—基本粒子．层次序列是现代系统科学的一个重要观点，认为现实世界的层次序列具有普遍性；
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整体性原理
在组合系统中，各部分参与相互作用，失去绝对独立性而形成统一体，统一体的性能支配着各部分的性能；人是典型的系统，中医学在其整体观点、阴阳学说、五行学说、脏腑学说、经络学说、“证”学说中，深刻地反映着人的整体性，其防治思想和防治法则中，包含并体现着整体性原理的基本内核，堪称为整体性原理的一种雏形。
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系统分析
系统分析指运用系统科学的原理对影响系统整体性能的各种因素进行全面分析考察的方法。结构分析、要素分析、环境分析、流程分析等，特别注意各种因素之间的相互关系，及由这些相互关系制约着的各因素为满足整体最佳而呈现的最佳适宜状态，而不是割断和抹杀相互关系把整体分解为各部分，从孤立的各部分之状态来说明整体。
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大系统理论
大系统理论是研究大系统的组成、结构、分解及功能分析与设计方法的理论。对许多经济学的，生物学的和医学的问题进行研究时，这种系统方法是不可少的．大系统也称巨系统，研究发现，人体的结构、功能及其生理、病理比巨系统还要复杂，90年代初又出现了开放复杂巨系统理论，它更加适合人体科学和医学研究的需要。
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一般系统论
20世纪20年代，贝塔朗菲在生物学研究中，批判了“整体一活力论”和“简化一还原论”的局限，提出了机体系统论，强调了生命机体的整体性、能动性、动态结构、等级组织，奠定了系统论的思想基础。一般系统论规定了“系统”这一科学概念，即处于一定的相互关系中并与环境发生关系的各组成部分（要素）的总体。