单链DNA

单链DNA

大部分DNA以双螺旋结构存在，但一经热或碱处理就会变为单链状态。单链DNA就是指以这种状态存在的DNA。单链DNA在分子流体力学性质、吸收光谱、碱基反应性质等方面都和双链DNA不同。某些噬菌体粒子内含有单链环状的DNA，这样的噬菌体DNA在细胞内增殖时则形成双链DNA。

ΦX174

概述：大肠杆菌噬菌体ΦX174由环状单链+DNA和一个蛋白质衣壳构成的小20面体病毒，属于微小噬菌体科微小噬菌体属。ΦX174基因组小，成熟噬菌体结构简单，是研究DNA复制、基因表达、DNA-蛋白质和蛋白质-蛋白质相互作用以及形态建成的很好系统。蛋白C端的疏水区在所有微小噬菌体中都保守，它可能参与DNA的包装。

肠杆菌噬菌体ΦX174

概述：大肠杆菌噬菌体ΦX174由环状单链+DNA和一个蛋白质衣壳构成的小20面体病毒，属于微小噬菌体科微小噬菌体属。ΦX174基因组小，成熟噬菌体结构简单，是研究DNA复制、基因表达、DNA-蛋白质和蛋白质-蛋白质相互作用以及形态建成的很好系统。蛋白C端的疏水区在所有微小噬菌体中都保守，它可能参与DNA的包装。

双生病毒科

双生病毒的传播主要通过媒介昆虫完成，玉米线条病毒属和曲顶病毒属成员主要由叶蝉传播，菜豆金黄花叶病毒属成员主要由粉虱传播。双链病毒各ORF编码蛋白功能了解甚少，目前已知双组分病毒基因组DNAA的V1ORF和和单组分基因组的V2ORF分别编码衣壳蛋白，并且由衣壳蛋白决定昆虫媒介的特异性。

细小病毒科

在部分病毒中也可检测到其它小阅读框。病毒复制在细胞核中进行，并可能需要宿主细胞通过它的S期，这说明宿主和病毒的复制关系密切，病毒复制可能涉及宿主的DNA复制酶，病毒基因组进入双链DNA需要前面的mRNA转录发生DNA合成由自体引物机制和存在的回文序列进行。一些mRNA的切割使蛋白产物的选择形式产生。

丝杆状病毒科

丝杆状病毒科病毒基因组复制时，亲代单链DNA转变成双链DNA复制形式（replicativeform，RF），RF半保留复制，合成子代单链DNA，病毒粒子通过从宿主细胞膜上挤压释放，释放时没有细胞裂解。因为其它长丝杆病毒和短丝杆病毒的双链RF形式已在细胞内检测到，它们的复制方式推断与含特异纤毛的大肠杆菌噬菌体相似。

N4样噬菌体属

中文名称：N4样噬菌体属英文名称：N4-likeviruses分类类型：属分类：有尾噬菌体目短尾噬菌体科N4样噬菌体属N4样噬菌体属成员：大肠杆菌噬菌体N4（EscherichiacolibacteriophageN4）N4样噬菌体属基本特性：N4样噬菌体属病毒粒子头等轴对称，直径约70nm，尾短，长度10nm，头尾连接处有一些短丝。

短浓核症病毒属

病毒粒子分成正链与负链两群，大部分（85％）的病毒粒子含负极性的单链DNA；编码结构蛋白与非结构蛋白的ORF均位于同一链上，在7mu与60mu处都有mRNA启动子，在互补链上有一未知功能的小ORF，在基因组3'末端有一个146个碱基的回文序列，而在5'末端则有一个不同的164个碱基回文序列，两个末端序列均能折叠成T形结构。

大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ

大肠杆菌DNA聚合酶（E.ColiDNApolymerase）主要有3种作用：①5’→3’的聚合作用。大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ的Klenow片段是完整的DNA聚合酶Ⅰ的一个片段，只有在5’→3聚合酶活性和3’→5’外切酶活性，失去了5’→3外切酶活性。如果供给32P标记的三磷酸核苷酸，则可使DNA带上同位素标记。

工具酶

工具酶是基因重组技术不可缺少的工具。限制性内切酶有Ⅰ型和Ⅱ型限制性DNA内切酶之分，Ⅱ型能严格识别核酸序列，并在识别区内特定的核苷酸处切开DNA双链。DNA连接酶可连接平端，也连接粘端。逆转录酶（以RNA为模板合成DNA，除RNA病毒中发现外，发现大肠埃希菌DNA聚合酶Ⅰ和TaqDNA聚合酶都有逆转录活性）。

滚环式复制

滚环式复制(rollingcirclereplication)是噬菌体中常见的DNA复制方式。噬菌体的双链DNA环状分子先在一条单链的复制起点上产生一个切口(nick)，然后以另一条单链为模板不断地合成新的单链。或是释放出的新合成的单链DNA，先被酶切割成单位长度形成单链环状DNA分子后再复制成双链环状DNA分子。

单链构象多态性

单链构象多态性（signlestrandconformationpolymorphism,SSCP）是指单链DNA由于碱基序列的不同可引起构象差异，这种差异将造成相同或相近长度的单链DNA电泳迁移率不同，从而可用于DNA中单个碱基的替代、微小的缺失或手稿的检测。

反转录酶

反转录酶（Reversetranscripatase）是以RNA为模板指导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA（cDNA）的酶。这种酶需要镁离子或锰离子作为辅助因子，当以mRNA为模板时，先合成单链DNA（ssDNA），再在反转录酶和DNA聚合酶Ⅰ作用下，以单链DNA为模板合成“发夹”型的双链DNA（dsDNA），再由核酸酶S1切成二条单链的双链DNA。

矮缩病毒属

完整的基因组信息分布于6个环状单链DNA分子上，由于矮缩病毒DNA结构与双生病毒科类似，至少有一个组分编码复制相关蛋白（Rep）。病毒是以双链DNA转录和复制链为模板，通过滚环复制方式进行复制。病毒宿主范围窄，自然侵染地三叶草、豌豆、蚕豆等豆科植物。病毒侵染的植物严重矮化，有些植物产生卷叶、褪绿甚至整株死亡。

双螺旋稳定蛋白

单链结合蛋白是又称为双螺旋稳定蛋白（helixdestabilizingprotein）。当解旋酶将双链打开以后，单链DNA具有一种潜在的恢复原来双链的能力，重新形成氢键。SSB对于细菌复制叉的结构的作用和解旋酶是同等的。这可能因为（1）SSB之间的相互作用；（2）第一个SSB和DNA的结合改变了DNA的结构。真核生物的SSB则不表现协同效应。

噬粒

噬粒(phagemid或phasmid)是由质粒载体和单链噬菌体载体构建成的。两者除了多克隆位点的序列正好相反外，其余的序列都是相同的，它们可在宿主细菌内像质粒一样地复制。辅助噬菌体是一类自身DNA复制效率极低的突变型，但可为宿主细胞的质粒DNA提供的复制和包装所需的蛋白酶和外壳蛋白。

基因探针

基因探针（probe）就是一段与目的基因或DNA互补的特异核苷酸序列，它可以包括整个基因，也可以仅仅是/基因的一部分；有了mRNA作模板后，在逆转录酶的作用下，就可以合成与之互补的DNA(即cDNA)，cDNA与待测基因的编码区有完全相同的碱基顺序，但内含子已在加工过程中切除。

核酸分子杂交促进剂

核酸分子杂交促进剂惰性多聚体可用来促进250个碱基以上的探针的杂交率。另一种常见的促进剂是聚乙二醇（PEG），PEG分子量小（6000～小分子化学试剂酚和硫氰酸胍也能促进杂交，它们可能是通过增加水的疏水性和降低双链和单链DNA间的能量差异而发挥作用。此外，该分子还可以促进RNA的杂交，有裂解细胞而抑制RNase的作用。

DNA探针

DNA探针是最常用的核酸探针，指长度在几百碱基对以上的双链DNA或单链DNA探针。这些DNA片段须是特异的，如细菌的毒力因子基因探针和人类Alu探针。真核基因中含有非编码的内含子序列，而原核则没有。DNA探针（包括cDNA探针）的主要优点有下面三点：①这类探针多克隆在质粒载体中，可以无限繁殖，取之不尽，制备方法简便。

逆转录

逆转录是RNA病毒的复制形式。逆转录反应包括以RNA为模板合成DNA、杂化双链上RNA的水解以及再以单链DNA为模板合成双链DNA三个步骤。在感染病毒的细胞内，逆转录酶能催化上述三步反应。逆转录现象的发现，加深了人们对中心法则的认识，拓宽了RNA病毒致癌、致病的研究。

艾特拉病毒属

中文名称：艾特拉病毒属英文名称：Iteravirus分类类型：属分类：浓核症病毒亚科艾特拉病毒属艾特拉病毒属成员：家蚕浓核症病毒（Bombyxmoridensovirus）新刺峨浓核症病毒（Casphaliaextraneadensovirus）暗色茅刺蛾浓核症病毒（Sibinefuscadensovirus）艾特拉病毒属基本特性：浓核症病毒粒子呈正二十面体，直径约20nm～

菜豆金色黄花叶病毒

菜豆金色黄花叶病毒主要侵染双子叶植物，在植物中的分布局限于韧皮部和相邻的薄壁细胞，病毒侵染喉细胞核呈现明显的病理变化，细胞核膨大并形成颗粒状结构和纤维状结构，纤维状物质科浓缩成各种大小的环。病毒感染细胞核中的颗粒物质主要是核糖蛋白，纤维物质主要是脱氧核糖蛋白，纤维环可能是病毒复制装配的场所。

AMDV

AMDV分类类型：种分类：细小病毒科细小病毒亚科阿留申病毒属阿留申水貂病病毒GeneBank编号：[M20036]阿留申水貂病病毒基本特性：阿留申水貂病毒是细小病毒科阿留申病毒属的成员，病毒基因组为单链DNA，分子大小约为4800bp。该病广泛流行于世界各养貂国家，我国也不例外，国内水貂养殖场水貂阿留申病感染率为40%～

鸡贫血病毒属

中文名称：鸡贫血病毒属英文名称：Gyrovirus分类类型：属分类：圆环病毒科鸡贫血病毒属鸡贫血病毒属成员：鸡贫血病毒（Chickenanemiavirus）鸡贫血病毒属基本特性：鸡贫血病毒属病毒粒子为20面体结构，直径17-22nm，无囊膜，鸡贫血病毒（CAV）具表面结构，而猪圆环病毒（PCV）和喙羽病病毒（BFDV）不出现表面结构。

圆环病毒属

圆环病毒RFDNA含有2个主要ORF，rep基因在病毒链上，cap基因在互补链上。圆环病毒属病毒的寄主范围和传播：病毒感染宿主，PCV-1和PCV-2局限于猪，而喙羽病病毒能感染40多种禽鸟，但大多数成员具有宿主专一性或窄宿主范围。主要传播途径为口-粪途径传播，猪圆环病毒2型和鸽圆环病毒可垂直传播。

cDNA

cDNA为具有与某RNA链呈互补的碱基序列的单链DNA即complementaryDNA之缩写，或此DNA链与具有与之互补的碱基序列的DNA链所形成的DNA双链。相反地对应于在原来基因中没有的而在mRNA存在的3′末端的多A序列等的核苷序列上，与exon序列、先导序列以及后续序列等一起反映出mRNA结构。cDNA同样可以被克隆。

单链断裂重组模型

单链断裂重组模型（modelofsingle-strandbreaksrecombination）该模型认为：同源染色体在联会期间，一对同源染色体各有一条单链DNA断裂，然后要发生重接，不过在重接的过程中发生了错误，不是原来断开的染色体重新连接起来而是交换连接，并且要通过一种Holliday中间结构的变化最后形成不同类型的重组体。

DNA拓扑异构酶

DNA拓扑异构酶DNAtopoisomerase是催化DNA拓扑学异构体相互转变的酶之总称。Ⅱ型拓扑异构酶，有存在于细菌中的DNA促旋酶、噬菌体T4的拓扑异构酶Ⅱ以及真核细胞中依赖ATP的拓扑异构酶Ⅱ等。真核细胞的拓扑异构酶Ⅰ，参与核小体的形成，细菌的ω蛋白参与转录和某种转位子的插入。

腺病毒群

腺病毒群adeno－associatedvirus缩写AAV。属细小病毒属，是最小型的病毒之一，病毒质粒直径18—25毫微米，其中含有分子量为1.5×106的单链DNA。单独存在时不具有自我增殖能力，所以在增殖过程中必须和辅助性病毒——腺病毒共同存在才行。从血清学方面现可分为四种，但有关其病原性尚不明瞭。

细小病毒

细小病毒亦称小脱氧核糖核酸病毒。据说有32个壳微体。第一亚群多由移植性肿瘤中分离，但无致肿瘤的性质。腺病毒对它的辅助作用，在病毒株之间没有特异选择性，仅仅根据AAV产生抗原，就能判断疱疹病毒也有辅助作用。所含的单链核酸，在不同的病毒粒子中是互补的，在核酸抽提过程中，它们互相结合，外观上有如双链的核酸。

小脱氧核糖核酸病毒

细小病毒亦称小脱氧核糖核酸病毒。据说有32个壳微体。第一亚群多由移植性肿瘤中分离，但无致肿瘤的性质。腺病毒对它的辅助作用，在病毒株之间没有特异选择性，仅仅根据AAV产生抗原，就能判断疱疹病毒也有辅助作用。所含的单链核酸，在不同的病毒粒子中是互补的，在核酸抽提过程中，它们互相结合，外观上有如双链的核酸。

RecA

RecA是是大肠杆菌中recA基因座的产物，具有双重功能，能激活蛋白酶并能改变单链DNA分子。蛋白酶-激活活性控制SOS反应；核酸酶活性涉及重组修复途径。

DNA复性

DNA的复性指变性DNA在适当条件下,二条互补链全部或部分恢复到天然双螺旋结构的现象,它是变性的一种逆转过程。这表明复性是相当理想的。简单顺序的DNA分子,如多聚(A)和多聚(U)这二种单链序列复性时,互补碱基的配对较易实现。对于原核生物核酸分子，此值可代表基因组的大小及基因组中核苷酸对的复杂程度。

单链结合蛋白

单链结合蛋白是又称为双螺旋稳定蛋白（helixdestabilizingprotein）。当解旋酶将双链打开以后，单链DNA具有一种潜在的恢复原来双链的能力，重新形成氢键。SSB对于细菌复制叉的结构的作用和解旋酶是同等的。这可能因为（1）SSB之间的相互作用；（2）第一个SSB和DNA的结合改变了DNA的结构。真核生物的SSB则不表现协同效应。

浓核症病毒亚科

病毒核酸为单链DNA或为正股或为负股，在体外抽取时，彼此相辅，碰在一起形成双股。家蚕浓核症病毒与腺联病毒2型和小鼠细小病毒不同的是，它还有一个ORF3，由基因组的另一条链编码167个氨基酸，可能是非结构蛋白，这一ORF3是昆虫浓核症病毒和哺乳动物细小病毒之间的明显差异。

小DNA病毒

小DNA病毒是一类已知最小的动物DNA病毒。26纳米的二十面体，无包膜。多数成员含负链DNA（碱基排列顺序与mRNA链互补的单链DNA）。广泛存在于人、脊椎动物、昆虫体内以及多种传代细胞中，仅少数致病。如小鹅瘟病毒，是中国各地雏鹅的一种致死性传染病的病原，用碱毒活疫苗免疫母鹅可预防雏鹅发病。

单链DNA卫星核酸组

中文名称：单链DNA卫星核酸组英文名称：SinglestrandedDNAsatellitesgroup分类类型：组分类：卫星体卫星核酸单链DNA卫星核酸组单链DNA卫星核酸组成员：藿香enation病毒卫星DNAβ（AgeratumenationvirussatelliteDNAβ）藿香黄脉病毒卫星DNAβ（AgeratumyellowveinvirussatelliteDNAβ）贝因迪黄脉花叶病毒卫星DNAβ（Bhend

单链DNA结合蛋白质

单链DNA结合蛋白质为DNA蛋白质之一种，是与单链DNA有强的亲和性，与DNA复制、遗传的重组等DNA代谢有关的蛋白质。单链DNA结合蛋白质在生物界广泛存在，B．Alberts等最早发现了噬菌体T4基因32形成的这种蛋白质。以后从细菌、霉菌、两栖类和哺乳类等细胞中也有分离出来。

阿留申水貂病病毒

AMDV分类类型：种分类：细小病毒科细小病毒亚科阿留申病毒属阿留申水貂病病毒GeneBank编号：[M20036]阿留申水貂病病毒基本特性：阿留申水貂病毒是细小病毒科阿留申病毒属的成员，病毒基因组为单链DNA，分子大小约为4800bp。该病广泛流行于世界各养貂国家，我国也不例外，国内水貂养殖场水貂阿留申病感染率为40%～

指环病毒科

推导的ORF1编码蛋白具有富含精氨酸序列、N端疏水序列，至少有两个氨基酸基元与病毒DNA的滚环复制（rollingcirclereplication，RCR）相关。指环病毒科病毒的宿主和传播：细环病毒和小细环病毒的宿主并不只局限于人，在除人之外的灵长动物（黑猩猩、猕猴、胥、夜猴）及树鼠句、猫、狗中都检测到该病毒。病毒全球分布。

甲型细环病毒属

细环病毒SEN的流行病学：健康人群感染率：不同人群SENV流行率各不相同：意大利健康献血人群中流行率较低。Wilson等报道静脉药瘾者血清SENV-D阳性率为37.7%，SENV-H阳性率为37.5%，平均9.3年后重新检测其病毒的持续状态发现SENV-D阳性率高达77.8%，SENV-H阳性率达55.6%，认为静脉吸毒可以再感染。戊型肝炎的主要病毒。

肠杆菌噬菌体PRD1

中文名称：肠杆菌噬菌体PRD1英文名称：EnterobacteriaphagePRD1分类类型：种分类：复层噬菌体科复层噬菌体属肠杆菌噬菌体PRD1GeneBank编号：[69077]肠杆菌噬菌体PRD1基本特性：复层噬菌体科是含生物膜的一群普通噬菌体，可以分为两个亚群，一个亚群感染革兰氏阳性菌，另一个亚群感染革兰氏阴性菌。P5也可作为三聚体存在。

PRD1

中文名称：肠杆菌噬菌体PRD1英文名称：EnterobacteriaphagePRD1分类类型：种分类：复层噬菌体科复层噬菌体属肠杆菌噬菌体PRD1GeneBank编号：[69077]肠杆菌噬菌体PRD1基本特性：复层噬菌体科是含生物膜的一群普通噬菌体，可以分为两个亚群，一个亚群感染革兰氏阳性菌，另一个亚群感染革兰氏阴性菌。P5也可作为三聚体存在。

微小噬菌体科

微小噬菌体科病毒基因组为单分子环状单链DNA，分子量1.6-1.7×106d，分子大小在4421bp到6050bp，一些基因从重叠阅读框翻译。使用宿主细胞的RNA聚合酶，mRNA从这个模板上转录，这种mRNA产生的一种蛋白（蛋白A）变成与亲代RF共价结合，导致子代RF复制。子代RF分子作为mRNA合成的模板，进一步复制RF。

抗脱氧核糖核酸抗体

概述：在各种自身免疫性疾病，如系统性红斑狼疮（SLE）等病人血清中常可检出抗脱氧核糖核核糖核酸（DNA）抗体，其中抗单链DNA（ssDNA）抗体可见于各种自身免疫病和结缔组织病人血液中，故无多大诊断特异性。相关疾病：系统性红斑狼疮、红斑狼疮、结节性多动脉炎、类风湿性关节炎、溃疡性结肠炎、重症肌无力、盘状红斑狼疮

浓核症病毒属

包被正链的病毒粒子与包被负链的病毒粒子在数量上相等。在一条链上有3个ORF编码非结构蛋白，使用一个mRNA启动子（距末端7mu）。鹿眼蛱蝶浓核症病毒具有一个517个碱基的反向末端重复序列，其前面的96个碱基可形成T形结构。