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薛氏医案
所注疏有王纶《明医杂著》，陈自明《外科精要》及《妇人大全良方》，陈文中《小儿痘疹方论》，钱乙《小儿药证直诀》，《保婴金镜录》；所校者有滑寿《难经本义》，倪维德《元机启微》，陶华《痈疽神秘验方》，朱震亨《平治荟萃》，马宗素《伤寒钤法》，杜清碧《敖氏伤寒金镜录》。薛铠所集者有《保婴撮要》；
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外科精要
主要内容：本书是在李迅、伍起予及曾孚先等人的外科学著作基础上进一步补充整理而成。明·薛己曾对此书予以增损补注，并附若干验案，收入《薛氏医案》中。主要内容：《外科精要》包括《内经纂要》、《杂症大小合参》、《脉诀纂要》、《女科精要》、《外科精要》、《药按》、《痘疹全集》、《杂症痘疹药性主治合参》八种。
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薛己
字新甫，号立斋。吴县（今江苏苏州）人。薛己生平著作甚多，如《外科枢要》、《内科摘要》、《校注妇人良方》等，还校补《痈疽神秘灸经》《十四经发挥》等。现存者有《内科摘要》、《女科撮要》、《外科枢要》、《外科经验方》、《疠疡机要》、《正体类要》、《本草约言》、《口齿类要》、《痘疹方论》及《薛氏医案》。
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女科撮要
概述：《女科撮要》为书名，2卷，明·薛己撰，刊于1548年。主要内容：《女科撮要》上卷列述经候不调、经漏不止等15类妇科疾病的证治和方药；下卷介绍保胎、小产等15类产科疾病的证治和方药，每类疾病后附有作者治案。现存版本：现有《薛氏医案》本。
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外科发挥
《外科发挥》为外科著作。明·薛己撰。刊于1528年。书中主要记述了作者治疗肿疡、溃疡、发背、脑疽、肺痈、肺痿、瘰疬、咽喉病、杨梅疮等31类外科疾患的验案。于每类验案前简述该病的治疗原则，后附治疗方剂，文字简明，切于实用。现有《薛氏医案》本。现存明刻本、石印本。
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十四经发挥
概述：《十四经发挥》为中医针灸著作，同名古籍有2本。卷中为“十四经脉气所发篇”，依据十二经脉和任督二脉的流注次序分别论述各经经穴歌诀相应脏腑机能、经穴部位和经脉主病等，是对元朝《金兰循经取穴图解》等书中有关十四经循行的文字详加考证，并有所发挥、补充；有明代复刻本，又被收入《薛氏医案二十四种》中。
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舌鉴
据本书凡例记载：“四川万县王文选所刻《活人心法》四册，内有《舌鉴》。据云：合张（登）氏一百二十舌，《薛氏医案》三十六舌，梁邑段正谊瘟疫十三舌，择录一百四十九舌…卷首有全舌分经图，称系明代良医所秘传。书中叙述各种病舌的证治比较简明，梁氏对原书中一些拘执五行以颜色生克推断病人预后的观点，持批判态度。
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本草发挥
《本草发挥》为药物学著作。明·徐彦纯撰。书成于明初。3将药物分为金石、草、木、人、兽、虫、鱼、果、米谷和菜共10类，收药270种；卷4为药物总论，内容多录自金、元诸医家著述中对药物的阐析与经验，作者未加注释，可供研究金元时代本草学的参考。现有《薛氏医案二十四种》本。
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平治荟萃
《平治荟萃》为书名。即《金匮钩玄》。元·朱震亨撰，明·戴原礼校补。2以内科杂病为主，兼述喉症及外科一些病证；卷3为妇人、小儿病证。分证论治，条理赅括，词旨简明。朱氏以补阴为宗，复长于治郁，书中较充分地反映了朱氏这方面的学术经验。又《薛氏医案》收入本书，改名《平治荟萃》。建国后有排印本。
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外科宝鉴
《外科宝鉴》为书名。即《外科精要》。宋·陈自明撰。刊于1263年。本书主要以李迅、伍起予及曾孚先等人的外科学著作为基础，进一步整理编成。作者认为外科用药，应根据经络虚实，因证施治，不可泥于热毒内攻，而专用寒凉克伐之剂。明·薛己曾对此书予以增损补注，并附若干验案，收入《薛氏医案》中。
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蛇盘疬
定义：蛇盘疬为病证名，即蟠蛇疬。见《证治准绳·疡医》卷三。瘰疬俗称瘰子颈、老鼠疮。又名鼠瘘、鼠疮、子疮、鼠疬、走鼠疮、蝼蛄疬、延珠瘭、野瘭、串疮等。《薛氏医案·瘰疬》：“其候多生于耳前后顼腋间，结聚成核，初觉憎寒发热，咽项强痛。”，连及颈颌，下连缺盆，皆为瘰疬，”瘰疬相当于西医的颈部淋巴结结核。
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金匮钩玄
概述：《金匮钩玄》为综合性医书，三卷。元·朱震亨撰。明·戴元礼校补。二以内科杂病为主，兼述喉症及外科一些病证；分证论治，条理赅括，词旨简明。朱氏倡阳常有余、阴常不足之说，治法以补阴为宗，复长于治郁，书中较充分地反映了朱氏这方面的学术经验。又《薛氏医案》收入本书，改名《平治荟萃》。1949年后有排印本。
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痈疽神秘验方
《痈疽神秘验方》痈疽验方专书。明·陶华撰。约成书于15世纪中期。本书收载根据痈疽的若干兼证制定内服和外用方共70余首，多属秘方或经验有效之方。后薛己将本书收入《薛氏医案》中，并附按语。
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钱氏儿科案疏
《钱氏儿科案疏》儿科医案著作。本书内容大体分两部。其一为张山雷氏将钱乙《小儿药证直诀》中所录的儿科医案23则及医案中所用的方剂加以注释。其二为何光华补入万全、缪仲醇、江瓘、喻昌等人的儿科医案22则及其治疗方剂，并予以补注。卷末附薛己在《薛氏医案》中所摘录的钱乙儿科医案的评注，作为对照。
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保婴金镜录
《保婴金镜录》儿科著作。成于明代，薛己注。约刊于16世纪中期。本书首载儿科面部色诊并治验30余则，次述小儿指纹诊法并治验10余则，末附儿科常用方剂60余首。本书对于小儿望诊论述较详。后收入《薛氏医案二十四种》中。现有明刻本及《薛氏医案》本。
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保婴撮要
《保婴撮要》儿科著作。明·薛铠撰。刊于1555年。前十卷论述婴儿初生护养儿、儿科疾病诊法、小儿变蒸、五脏生病，以及幼儿内科杂病的证治；后十卷论述有关幼外科、皮科及痘疹等病证治及其医案，均为薛己所撰。书中不仅介绍了较丰富的治法，并收载了大量儿科医案，为本书的特色之一。现有多种明刻本及《薛氏医案》本。
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元机启微
《元机启微》为眼科著作。又名《原机启微》。明初·倪维德撰，明·薛己校注。初刊于1370年。卷上论眼病病因及治则共九论；卷下论方剂配伍附40余方及方义的说明。薛己将此书收入《薛氏医案》时，将其本人之见闻和经验，另撰附录1卷，包括11论及70余附方。建国后有排印本。
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外科枢要
概述：《外科枢要》为外科著作。明·薛己撰。刊于1571年。主要内容：卷一载疮疡诊候辨证共21论；三以病证为纲，分论全身各部疮疡共30余病的证治，并附验案；卷四总列疮疡各证治疗方剂。现存版本：现存三种明刻本等。现有《薛氏医案》本。
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疠疡机要
概述：《疠疡机要》为麻风专著。明·薛己撰。约刊于16世纪中叶。主要内容：本书对麻风病的本症、变症、兼症与类症的辨证治疗等予以全面阐论和辨析。尤其可贵的是本书收载麻风病治疗验案较多论述病候，条目比较清晰。现存版本：现有《薛氏医案》本。
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口齿类要
约刊于16世纪中期。主要内容：《口齿类要》记载了茧唇、口疮、齿痛、舌症、喉痹、喉间杂症等12类口齿科疾病的辨证验案与方剂。《口齿类要》对口齿各科疾病的认识颇有见地，如其论茧唇病时，强调“若患者忽略，治者不察，妄用清热清毒药，或用药线结去，反为翻花败症矣”。由此看出薛己在当时对唇癌一病已有较明确的认识。
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天机启微
卷下论眼病制方之法，详述君臣佐使和正反逆从等配伍原则。所附46方，皆载炮制方法、方义及适应病症，此书按病因病机来分析眼病，将眼病分为淫热、风热、七情五贼、血凝、气散、热积之血等18类，又与人体功能及外部环境联系起来，审因论证，立法处方，十分详备。薛己将此书收入《薛氏医案》时，将其本人之见闻和经验；
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舌鉴辨正
《舌鉴辨正》为舌诊著作。清·梁玉瑜传，陶保廉录。书成于1894年。据本书凡例记载：“四川万县王文选所刻《活人心法》四册，内有《舌鉴》。卷首有全舌分经图，称系明代良医所秘传。书中叙述各种病舌的证治比较简明，梁氏对原书中一些拘执五行以颜色生克推断病人预后的观点，持批判态度。
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明医杂著
《明医杂著》综合性医书。明·王纶撰，薛己注。此书系王氏医学杂著。前三卷医论部分，论述内科杂病以及妇产科、眼耳、鼻、齿等病证治。其中也分析了李杲、朱震亨治法及方论。末附元·滑寿《诊家枢要》；王氏原撰于1502年。目前流通本为《薛氏医案》本，由薛己另加注按，或附医案，内容颇有发挥。1949年后有排印本。
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齐秉慧
齐秉慧（18世纪）为清代医家。初习儒，后因多病，未获良医，遂自行研治，阅《薛氏医案》，选其中补益方自治而见效，服数百剂竟愈。临证主张严格辨证，于痨瘵、咳血、下痢、痘疹诸症，均有所研究。编有《齐氏医书四种》（1806年刻行），包括：《医案》、《家传医秘》、《痢症汇参》、《痘麻医案》。
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蟠蛇疬
定义：蟠蛇疬（coiledsnakescrofulapericervicalscrofula）为病名。又名蛇盘疬。又名鼠瘘、鼠疮、子疮、鼠疬、走鼠疮、蝼蛄疬、延珠瘭、野瘭、串疮等。《薛氏医案·瘰疬》：“其候多生于耳前后顼腋间，结聚成核，初觉憎寒发热，咽项强痛。”，连及颈颌，下连缺盆，皆为瘰疬，”瘰疬相当于西医的颈部淋巴结结核。