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基因诊断及其临床应用
...入突变、被分析的DNA中有无某个基因的存在等。 3.1.3单链构象多态性检测(SSCP)单链构象多态性检测是一种基于单链DNA构象差别来检测点突变的方法。DNA经变性形成单链后,在中性条件下单链DNA会因其分子内碱基之间的相互...
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胰腺癌p16基因mRNA异常表达的研究
...腺癌中p16基因mRNA的表达情况,同时应用聚合酶链式反应-单链构象多态性分析(PCR-SSCP)对其异常表达的原因进行分析,现将结果报道如下。 一、材料和方法 1.对象:新鲜胰腺癌组织10例取自中国医科大学第一临床学院普通...
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第二节 常用基因诊断技术
...了时间,而且只要极少量的基因组DNA就可进行。 五、单链构象多态性诊断法 单链构象多态性(signlestrandconformationpolymorphism,SSCP)是指单链DNA由于碱基序列的不同可引起构象差异,这种差异将造成相同或相近长度的单链DNA...
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系统性红斑狼疮患者白细胞介素-4受体基因多态性的研究
...斑狼疮(SLE)患者发病的相关性。研究者采用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)和聚合酶链反应限制性片段多态性(PCR-RFLP)及DNA测序方法进行基因分型。结果ile50/ile50基因型与SLE易感性有显著相关。其他基因型在两组患者间的分...
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肝癌相关基因单核苷酸多态性基因芯片制备与检测分析
...检测分析,而对7例患者的部分检测结果用聚合酶链反应-单链构象多态性法(PCR-SSCP)和测序进行验证。结果显示,芯片检测的灵敏度为6×10-3ng/μl,检测重复率高于95.83%,随探针浓度降低,杂交信号逐渐减弱。10份肝癌患者组织...
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P53基因突变与食管癌转移关系临床研究
...变与食管癌淋巴结转移的关系。方法采用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)结合银染技术,对48例食管癌患者组织中P53基因第5~8外显子进行了突变分析。结果48例食管癌标本中,P53基因第5~8外显子出现突变者21例,其突...
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先天性无虹膜症家系的基因突变位点研究
...关;PCR扩增PAX6基因的所有外显子,所有PCR产物分别进行单链构象多态性(SSCP)分析,通过患者与正常人带型的差异确定突变发生的外显子,对有差异SSCP带型的PCR产物进行直接DNA测序,找到突变位点。结果该家系先天性无虹膜表型...
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新发现的中国人ATP结合盒转运子A1基因M233V单核苷酸多态性及其家系调查
...者家系进行调查确定其意义。研究者用聚合酶链反应(PCR)-单链构象多态性分析(SSCP)-DNA测序及限制性酶切发现ABCA1基因新的SNP,进一步对先证者家系的16位成员进行血脂检查、基因组DNA提取及限制性酶切分析。结果M233V是一个新发...
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遗传性痉挛性截瘫spastin、atlastin和paraplegin基因突变分析
...stin和paraplegin基因的突变特点,研究者应用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)结合DNA序列分析方法对24个常染色体显性遗传HSP家系和14例散发患者进行spastin基因和atlastin基因突变分析,对12个常染色体隐性遗传HSP家系和14例散发...
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乳腺癌细胞p16基因的研究
...培养,反复贴壁法纯化人乳腺癌细胞,经多聚酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析技术,对14例纯化乳腺癌细胞标本、14例新鲜未纯化标本和27例石蜡包埋标本及相应的癌旁乳腺组织标本的p16基因突变率进行了对比性研究。结...
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中国一家系Brugada综合征相关基因SCN5A突变位点的检测
...因突变检测,同时对136例家系外健康对照者的该位点进行单链构象多态性分析。结果发现在Brugada家系中发现了两个杂合变异,即SCN5A基因第二外显子上发现一个同义变异(A129G),没有导致氨基酸的改变(A29A);第26外显子发现...
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结核分枝杆菌利福平耐药基因rpoB突变特征初步分析
...药决定区(RRDR)81个碱基在内的286bp片段进行聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析,并对经检测显示有突变的结核分枝杆菌rpoB基因此扩增区域进行序列测定。其中利福平耐药株73株,非利福平耐药株11株,敏感株26株。结果PCR-S...
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Cav1.1基因26内含子67位点A/G多态性与甲状腺功能亢进性周期性瘫痪的相关性研究
...)性周期性瘫痪(TPP)的相关性。研究者采用多聚酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法检测46例男性TPP患者(TPP组)、68例男性甲亢患者(GD组)和72名男性健康对照者(CON组)Cav1.1基因26内含子-67A/G多态性。分析比较此多态位点基因型和等位...
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中国先天性缺失牙患者PAX9基因的新突变
...病的分子机制研究提供依据。研究者应用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析方法,对4个常染色体显性遗传少牙畸形家系(共45名成员,22例患者)中的13例患者和9名健康成员、16例散发性牙齿发育不全患者以及196名健康对照...
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成年发病狼疮鼠的T细胞受体Vβ基因测序分析
...中的TCRVβ6基因,对扩增产物进行基因克隆和DNA测序分析,单链构象多态性分析法(SSCP)鉴定广泛浸润的T细胞克隆TCRVβ6基因编码的氨基酸基序。结果两种成年发病狼疮鼠的不同个体之间,广泛浸润于多脏器的T细胞克隆TCRVβ6基因的互...
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良性家族性婴儿惊厥家系KCNQ2基因新突变
...直接测序技术进行KCNQ2基因突变分析,采用多聚酶链反应-单链构象多态性进行基因型和表型共分离研究。结果PCR-DNA直接测序在先证者第5号外显子发现KCNQ2基因杂合突变G812T,导致KCNQ2蛋白孔区一个甘氨酸被缬氨酸替代(G27lⅤ),这...
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中性粒细胞集落刺激因子基因多态性与系统性红斑狼疮相关性的研究
...统性红斑狼疮(SLE)的相关性。研究者采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法对中国北方汉族人群Csf3基因进行了单核苷酸多态性(SNP)的筛选,通过比较SNP各基因型和等位基因在正常人和SLE患者中分布来研究Csf3与SLE/狼疮肾...
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单发性与多发性瘢痕疙瘩转化生长因子-β1Ⅱ型受体PolyA位点基因突变研究
...设计并合成引物,利用PCR仪扩增TβRⅡDNA;对PCR产物进行单链构象多态性分析(PCR-SSCP),PCR产物纯化后,利用自动测序仪鉴定基因突变的类型。结果瘢痕疙瘩组织中TβRⅡPolyA位点表现出基因缺失突变,其阳性率多发性瘢痕疙瘩为50%(3/...
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野生型p53对涎腺多形性腺瘤细胞突变基因的修复
...科大学口腔医学院病理科王旭等研究人员研究显示,PCR-单链构象多态性分析显示,3例出现异常电泳带。核酸序列测定结果显示,第6外显子的第203号密码子点突变;第8外显子的第272至290号密码子之间出现碱基缺失和碱基插入。...
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湖北地区原发性先天性青光眼患儿CYP1B1基因的新突变研究
...1基因的第2、3外显子,琼脂糖凝胶电泳鉴定产物后,应用单链构象多态性(SSCP)、变性高效液相色谱分析(DHPLC)及DNA序列分析技术对患儿和对照组进行基因分析。结果发现7例PCG患儿呈现CYP1B1基因的第3外显子第385密码子的第1个...
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基因突变检测技术
...链DNA不同的迁移率,从而使两者被分离开。该方法原理与单链构象多态性(SSCP)相似,只不过SS-CP分离的是单链,而HA法分离的是双链。HA法简单迅速,但只适用于200~300pb的片段,且不能确定突变位置,检出率只有80%左右,有人建议将HA法和S...
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基因检测在遗传性耳聋中的应用
...得很难通过一次测序获得精确的数据。3.2限制酶切指纹-单链构象多态性分析(restrictionendonucleasefingerprinting-singlestrandconformationpolymorphism,REF-SSCP):限制性核酸内切酶切割目标基因的PCR扩增产物,琼脂糖凝胶电泳检测梅切产物,...
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PCR-RFLP-SSCP及测序用于霍乱弧菌ctx-AB基因多态性的研究
...PCR产物经RsaⅠ酶切为317bp和211bp2个片段。对酶切产物进行单链构象多态性(SSCP)分析,银染色法显示结果。对不同SSCP类型测序,利用PCR方法直接对PCR产物测序。 霍乱弧菌O1群古典型(CVC)标准株569B和16017,埃尔托型(EVC)标准株919,...
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苯丙酮尿症的筛查和治疗进展
...诊断为PKU[6]。(3)PCR检测。金煜炜等[7]建立了联合应用PCR-单链构象多态性和短串联重复序列连锁分析方法产前诊断PKU患儿,初步结果表明该方法准确性高,具有较高的临床应用价值。目前对PKU患者的筛查和临床检验已经达到基因...
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国人视网膜色素变性患者的RDS基因突变及表型研究
...用2对引物),以醋酸铵-异丙醇沉淀法回收PCR产物。通过单链构象多态性(SSCP)分析筛查RDS基因突变。沉淀回收PCR产物以20μl变性上样液溶解后热变性为2条DNA单链后,上样于8%非变性聚丙烯酰胺凝胶,700V电压、4℃电泳16h,银染...
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基于印刷电化学芯片技术的单核苷酸多态性快速、简便检测
...伸法,寡核苷酸连接分析法,聚合酶链反应产物DNA测序,单链构象多态性,质谱法及异源双链技术等[5,6]。生物芯片[7,8]技术的出现及飞速发展为高通量、自动化的基因检测,包括单核苷酸多态性检测提供了可能,基因芯片成...
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肾透明细胞癌中VHL基因改变和趋化因子受体CXCR4的表达及相关性
...探讨VHL基因在CCRCC中的作用。方法分别采用聚合酶链反应-单链构象多态性分析、微卫星法、DNA甲基化特异性PCR和半定量逆转录PCR检测35例CCRCC和20例正常肾组织中VHL基因突变、杂合性缺失(LOH)、异常甲基化及CXCR4mRNA的表达。结果VHL...
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毛细管电泳――基因突变及多态性分析新方法
...性分析方法以及毛细管电泳在该领域中的应用。主要包括单链构象多态性分析,变性梯度及温度梯度电泳,杂合子分析,限制性片段多态性分析,等位基因特异性扩增,核酸杂交,引物扩展及小卫星和微卫星分析。关键词:毛细...
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毛细管电泳――基因突变及多态性分析新方法
...性分析方法以及毛细管电泳在该领域中的应用。主要包括单链构象多态性分析,变性梯度及温度梯度电泳,杂合子分析,限制性片段多态性分析,等位基因特异性扩增,核酸杂交,引物扩展及小卫星和微卫星分析。关键词:毛细...
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三、HLA抗原的检测
...PCR为基础的其它DNA分型所取代。 (3)PCR-SSCP:即PCR与单链构象多态性(singlestrandconformationpolymorphism,SSCP)分析相结合的方法。其原理是单链DNA可形成稳定的构象,在非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳中其迁移率不仅与链的大小有关...