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全外显子测序 (WES)
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<div style="padding: 0 4%; line-height: 1.8; color: #1e293b; font-family: 'Helvetica Neue', Helvetica, 'PingFang SC', Arial, sans-serif; background-color: #ffffff; max-width: 1200px; margin: auto;"> <div style="margin-bottom: 30px; border-bottom: 1.2px solid #e2e8f0; padding-bottom: 25px;"> <p style="font-size: 1.1em; margin: 10px 0; color: #334155; text-align: justify;"> <strong>[[全外显子组测序]] (Whole Exome Sequencing, WES)</strong> 是一种利用 <strong>[[二代测序 (NGS)]]</strong> 技术,针对基因组中约 1%-2% 的 <strong>[[外显子 (Exon)]]</strong> 区域(即蛋白质编码区域)进行高深度测序的方法。尽管外显子仅占基因组的一小部分,但人类约 85% 的致病突变都集中于此。在 <strong>[[进化肿瘤学]]</strong> 中,WES 是识别肿瘤 <strong>[[新抗原]]</strong>、计算 <strong>[[肿瘤突变负荷 (TMB)]]</strong> 以及构建 <strong>[[系统发育树]]</strong> 以追踪 <strong>[[克隆漂移]]</strong> 的金标准工具。 </p> </div> <div class="medical-infobox mw-collapsible mw-collapsed" style="width: 380px; float: right; margin: 0 0 25px 25px; border: 1.2px solid #bae6fd; border-radius: 12px; background-color: #ffffff; box-shadow: 0 8px 20px rgba(0,0,0,0.05); overflow: hidden;"> <div style="padding: 15px; color: #1e40af; background: linear-gradient(135deg, #e0f2fe 0%, #bae6fd 100%); text-align: center; cursor: pointer;"> <div style="font-size: 1.25em; font-weight: bold; letter-spacing: 1.2px;">全外显子测序 (WES)</div> <div style="font-size: 0.7em; opacity: 0.85; margin-top: 4px; white-space: nowrap;">Whole Exome Sequencing · 核心档案</div> </div> <div class="mw-collapsible-content"> <div style="padding: 20px; text-align: center; background-color: #f8fafc;"> <div style="font-size: 0.8em; color: #64748b; margin-top: 10px; font-weight: 600;">核心任务:精准捕捉蛋白编码变异</div> </div> <table style="width: 100%; border-collapse: collapse; font-size: 0.82em;"> <tr style="background-color: #f1f5f9; color: #1e40af; font-weight: bold; text-align: center;"> <td colspan="2" style="padding: 6px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">技术规格</td> </tr> <tr> <th style="text-align: left; padding: 6px 10px; background-color: #f8fafc; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; width: 40%;">覆盖范围</th> <td style="padding: 6px 10px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #0f172a;">约 30-50 Mb (编码区)</td> </tr> <tr> <th style="text-align: left; padding: 6px 10px; background-color: #f8fafc; border-bottom: 1px solid #f1f5f9;">典型测序深度</th> <td style="padding: 6px 10px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #1e40af;">100x - 500x (体细胞变异)</td> </tr> <tr> <th style="text-align: left; padding: 6px 10px; background-color: #f8fafc; border-bottom: 1px solid #f1f5f9;">主要发现物</th> <td style="padding: 6px 10px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #0f172a;">SNV, Indel, CNV</td> </tr> <tr style="background-color: #f1f5f9; color: #1e40af; font-weight: bold; text-align: center;"> <td colspan="2" style="padding: 6px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">肿瘤学价值</td> </tr> <tr> <th style="text-align: left; padding: 6px 10px; background-color: #f8fafc; border-bottom: 1px solid #f1f5f9;">预测指标</th> <td style="padding: 6px 10px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #1e40af;">[[tTMB]] (组织 TMB)</td> </tr> <tr> <th style="text-align: left; padding: 6px 10px; background-color: #f8fafc; border-bottom: 1px solid #f1f5f9;">疫苗研发</th> <td style="padding: 6px 10px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #0f172a;">[[个体化新抗原]]鉴定</td> </tr> <tr> <th style="text-align: left; padding: 6px 10px; background-color: #f8fafc;">进化分析</th> <td style="padding: 6px 10px; color: #1e40af;">亚克隆解析</td> </tr> </table> </div> </div> <h2 style="background: #f1f5f9; color: #0f172a; padding: 10px 18px; border-radius: 0 6px 6px 0; font-size: 1.25em; margin-top: 40px; border-left: 6px solid #0f172a; font-weight: bold;">技术原理:捕捉与扩增</h2> <p style="margin: 15px 0; text-align: justify;"> WES 不同于 <strong>[[全基因组测序 (WGS)]]</strong>,它增加了一个关键的 <strong>[[文库富集 (Enrichment)]]</strong> 步骤: </p> <ul style="padding-left: 25px; color: #334155;"> <li style="margin-bottom: 12px;"><strong>探针杂交:</strong> 利用特异性设计的 DNA/RNA 探针(Bait)与基因组中的外显子区域互补结合。</li> <li style="margin-bottom: 12px;"><strong>磁珠捕获:</strong> 通过链霉亲和素磁珠将结合了探针的目标 DNA 片段从复杂的基因组背景中分离出来,洗脱非编码区域。</li> <li style="margin-bottom: 12px;"><strong>深度测序:</strong> 对富集后的外显子片段进行大规模平行测序。由于范围缩小,可以在相同成本下获得比 WGS 更高的测序深度,从而捕捉到低丰度的 <strong>[[亚克隆突变]]</strong>。</li> </ul> <h2 style="background: #f1f5f9; color: #0f172a; padding: 10px 18px; border-radius: 0 6px 6px 0; font-size: 1.25em; margin-top: 40px; border-left: 6px solid #0f172a; font-weight: bold;">WES 在肿瘤诊疗中的核心应用</h2> <div style="overflow-x: auto; margin: 20px auto;"> <table style="width: 100%; border-collapse: collapse; border: 1.2px solid #cbd5e1; font-size: 0.92em; text-align: left;"> <tr style="background-color: #f8fafc; border-bottom: 2px solid #0f172a;"> <th style="padding: 12px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #0f172a; width: 25%;">应用维度</th> <th style="padding: 12px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #475569;">技术逻辑</th> <th style="padding: 12px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #1e40af;">临床产出</th> </tr> <tr> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; font-weight: 600;">[[新抗原]]发现</td> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">对比肿瘤组织 WES 与正常组织(如血液)WES。</td> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">识别体细胞突变(Somatic Mutations),指导 <strong>[[个体化多肽疫苗]]</strong> 研发。</td> </tr> <tr> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; font-weight: 600;">[[TMB]] 评估</td> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">对全编码区非同义突变进行计数。</td> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #1e40af;">作为免疫治疗疗效预测的“金标准”。</td> </tr> <tr> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; font-weight: 600;">进化分枝图</td> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">分析不同病灶间的突变共有性。</td> <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #1e40af;">识别 <strong>[[主干突变 (Trunk)]]</strong> 与 <strong>[[分枝突变 (Branch)]]</strong>,量化异质性。</td> </tr> </table> </div> <h2 style="background: #f1f5f9; color: #0f172a; padding: 10px 18px; border-radius: 0 6px 6px 0; font-size: 1.25em; margin-top: 40px; border-left: 6px solid #0f172a; font-weight: bold;">权威参考文献 [2026 深度校验]</h2> <div style="font-size: 0.92em; line-height: 1.6; color: #1e293b; margin-top: 15px; border-top: 2.2px solid #0f172a; padding: 15px 25px; background-color: #f8fafc; border-radius: 0 0 10px 10px;"> <p style="margin: 12px 0; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; padding-bottom: 10px;"> [1] <strong>Ng, S. B., et al. (2009).</strong> <em>Targeted capture and next-generation sequencing of the human exome.</em> <strong>Nature</strong>, 461(7261), 272-276.<br> <span style="color: #475569;">[核心价值]:WES 技术在人类基因组研究中的奠基性文献。</span> </p> <p style="margin: 12px 0; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; padding-bottom: 10px;"> [2] <strong>Chalmers, Z. R., et al. (2017).</strong> <em>Analysis of 100,000 human cancer genomes reveals the landscape of tumor mutational burden.</em> <strong>Genome Medicine</strong>, 9(1).<br> <span style="color: #475569;">[临床应用]:定义了 WES 作为衡量 TMB 基准的重要地位。</span> </p> <p style="margin: 12px 0; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; padding-bottom: 10px;"> [3] <strong>Turajlic, S., et al. (2018).</strong> <em>Deterministic evolutionary trajectories influence primary tumor growth: TRACERx.</em> <strong>Nature</strong>, 557.<br> <span style="color: #475569;">[进化视角]:展示了多区域 WES 测序在解析肿瘤演化动力学中的决定性作用。</span> </p> </div> <h2 style="background: #f1f5f9; color: #0f172a; padding: 10px 18px; border-radius: 0 6px 6px 0; font-size: 1.25em; margin-top: 40px; border-left: 6px solid #0f172a; font-weight: bold;">相关概念内链</h2> <div style="background-color: #f8fafc; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 8px; padding: 15px; margin: 20px 0;"> <ul style="margin: 0; padding-left: 20px; color: #334155;"> <li style="margin-bottom: 8px;"><strong>[[全基因组测序 (WGS)]]:</strong> 包含非编码区的全面检测,但成本较高,通常用于复杂结构变异分析。</li> <li style="margin-bottom: 8px;"><strong>[[新抗原]]:</strong> WES 识别出的体细胞非同义突变是其核心来源。</li> <li style="margin-bottom: 8px;"><strong>[[靶向基因 Panel]]:</strong> 仅检测几十到几百个核心基因,成本低但无法提供全景 TMB 信息。</li> </ul> </div> <div style="margin: 40px 0; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 8px; overflow: hidden; font-family: 'Helvetica Neue', Arial, sans-serif; font-size: 0.9em;"> <div style="background-color: #eff6ff; color: #1e40af; padding: 8px 15px; font-weight: bold; text-align: center; border-bottom: 1px solid #dbeafe;"> 全外显子测序 (WES) · 知识图谱 </div> <table style="width: 100%; border-collapse: collapse; background-color: #ffffff;"> <tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"> <td style="width: 110px; background-color: #f8fafc; color: #334155; font-weight: 600; padding: 10px 12px; text-align: right; vertical-align: middle; white-space: nowrap;">关键步奏</td> <td style="padding: 10px 15px; color: #334155;">[[探针杂交捕获]]•[[高深度 NGS]]•[[生信变异分析]]</td> </tr> <tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"> <td style="width: 110px; background-color: #f8fafc; color: #334155; font-weight: 600; padding: 10px 12px; text-align: right; vertical-align: middle; white-space: nowrap;">数据产出</td> <td style="padding: 10px 15px; color: #334155;">[[胚系变异 (Germline)]]•[[体细胞突变 (Somatic)]]•[[拷贝数变异 (CNV)]]</td> </tr> <tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"> <td style="width: 110px; background-color: #f8fafc; color: #334155; font-weight: 600; padding: 10px 12px; text-align: right; vertical-align: middle; white-space: nowrap;">局限性</td> <td style="padding: 10px 15px; color: #334155;">[[无法检测非编码区变异]]•[[对结构重排灵敏度低]]•[[存在捕获偏好性]]</td> </tr> </table> </div> </div>
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