查看“二代测序 (NGS)”的源代码

<div style="padding: 0 4%; line-height: 1.8; color: #1e293b; font-family: 'Helvetica Neue', Helvetica, 'PingFang SC', Arial, sans-serif; background-color: #ffffff; max-width: 1200px; margin: auto;">

    <div style="margin-bottom: 30px; border-bottom: 1.2px solid #e2e8f0; padding-bottom: 25px;">
        <p style="font-size: 1.1em; margin: 10px 0; color: #334155; text-align: justify;">
            <strong>[[二代测序]] (Next-Generation Sequencing, NGS)</strong>，又称大规模平行测序，是现代 <strong>[[精准医疗]]</strong> 的技术基石。与传统 Sanger 测序相比，NGS 能够同时对数百万到数十亿个 DNA 片段进行并行测序，极大地提高了检测通量并降低了成本。在肿瘤学领域，NGS 不仅用于识别 <strong>[[EGFR]]</strong>、<strong>[[ALK]]</strong> 等驱动基因突变以指导靶向治疗，更是发现 <strong>[[新抗原]] (Neoantigen)</strong>、计算 <strong>[[肿瘤突变负荷 (TMB)]]</strong> 以及进行 <strong>[[液体活检]]</strong> 的核心工具。
        </p>
    </div>

    <div class="medical-infobox mw-collapsible mw-collapsed" style="width: 380px; float: right; margin: 0 0 25px 25px; border: 1.2px solid #bae6fd; border-radius: 12px; background-color: #ffffff; box-shadow: 0 8px 20px rgba(0,0,0,0.05); overflow: hidden;">
        
        <div style="padding: 15px; color: #1e40af; background: linear-gradient(135deg, #e0f2fe 0%, #bae6fd 100%); text-align: center; cursor: pointer;">
            <div style="font-size: 1.25em; font-weight: bold; letter-spacing: 1.2px;">二代测序 (NGS)</div>
            <div style="font-size: 0.7em; opacity: 0.85; margin-top: 4px; white-space: nowrap;">Massively Parallel Sequencing · 档案</div>
        </div>
        
        <div class="mw-collapsible-content">
            <div style="padding: 20px; text-align: center; background-color: #f8fafc;">
                
                <div style="font-size: 0.8em; color: #64748b; margin-top: 10px; font-weight: 600;">核心特性：高通量与数字化</div>
            </div>

            <table style="width: 100%; border-spacing: 0; border-collapse: collapse; font-size: 0.82em;">
                <tr style="background-color: #f1f5f9; color: #1e40af; font-weight: bold; text-align: center;">
                    <td colspan="2" style="padding: 6px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">技术规格</td>
                </tr>
                <tr>
                    <th style="text-align: left; padding: 6px 10px; background-color: #f8fafc; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; width: 40%;">基本原理</th>
                    <td style="padding: 6px 10px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #0f172a;">边合成边测序 (SBS)</td>
                </tr>
                <tr>
                    <th style="text-align: left; padding: 6px 10px; background-color: #f8fafc; border-bottom: 1px solid #f1f5f9;">数据长度</th>
                    <td style="padding: 6px 10px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #1e40af;">短读长 (50-300 bp)</td>
                </tr>
                <tr>
                    <th style="text-align: left; padding: 6px 10px; background-color: #f8fafc; border-bottom: 1px solid #f1f5f9;">主要平台</th>
                    <td style="padding: 6px 10px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #0f172a;">Illumina, MGI, Ion Torrent</td>
                </tr>
                <tr style="background-color: #f1f5f9; color: #1e40af; font-weight: bold; text-align: center;">
                    <td colspan="2" style="padding: 6px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">肿瘤学应用指标</td>
                </tr>
                <tr>
                    <th style="text-align: left; padding: 6px 10px; background-color: #f8fafc; border-bottom: 1px solid #f1f5f9;">变异检测</th>
                    <td style="padding: 6px 10px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #0f172a;">SNV, Indel, CNV, 融合基因</td>
                </tr>
                <tr>
                    <th style="text-align: left; padding: 6px 10px; background-color: #f8fafc; border-bottom: 1px solid #f1f5f9;">样本类型</th>
                    <td style="padding: 6px 10px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #1e40af;">组织、血浆 (cfDNA)、单细胞</td>
                </tr>
                <tr>
                    <th style="text-align: left; padding: 6px 10px; background-color: #f8fafc;">关键应用</th>
                    <td style="padding: 6px 10px; color: #0f172a;">[[新抗原]]预测、耐药监测</td>
                </tr>
            </table>
        </div>
    </div>

    <h2 style="background: #f1f5f9; color: #0f172a; padding: 10px 18px; border-radius: 0 6px 6px 0; font-size: 1.25em; margin-top: 40px; border-left: 6px solid #0f172a; font-weight: bold;">NGS 在肿瘤诊疗中的全流程应用</h2>

    <p style="margin: 15px 0; text-align: justify;">
        NGS 已从实验室工具演变为临床决策的“导航仪”，涵盖了从筛查到晚期治疗的每一个阶段：
    </p>
    <ul style="padding-left: 25px; color: #334155;">
        <li style="margin-bottom: 12px;"><strong>伴随诊断与靶向选择：</strong> 通过 <strong>[[多基因联合检测 (Panel)]]</strong> 快速锁定可获益的药物靶点（如肺癌中的 11 个经典驱动基因）。</li>
        <li style="margin-bottom: 12px;"><strong>免疫治疗生物标志物：</strong> 评估 <strong>[[微卫星不稳定 (MSI)]]</strong> 和 <strong>[[肿瘤突变负荷 (TMB)]]</strong>，预测患者对免疫检查点抑制剂 (ICI) 的应答可能性。</li>
        <li style="margin-bottom: 12px;"><strong>[[个体化疫苗]]研发：</strong> 通过对比肿瘤细胞与正常细胞的外显子序列（WES），结合转录组（RNA-seq），利用 <strong>[[AI 辅助表位筛选]]</strong> 识别用于合成 <strong>[[个体化多肽疫苗]]</strong> 的候选肽段。</li>
    </ul>

    [Image showing the step-by-step NGS workflow: Library Prep -> Sequencing -> Bioinformatic Analysis]

    <h2 style="background: #f1f5f9; color: #0f172a; padding: 10px 18px; border-radius: 0 6px 6px 0; font-size: 1.25em; margin-top: 40px; border-left: 6px solid #0f172a; font-weight: bold;">不同测序策略的临床价值对比</h2>

    <div style="overflow-x: auto; margin: 20px auto;">
        <table style="width: 100%; border-collapse: collapse; border: 1.2px solid #cbd5e1; font-size: 0.92em; text-align: left;">
            <tr style="background-color: #f8fafc; border-bottom: 2px solid #0f172a;">
                <th style="padding: 12px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #0f172a; width: 25%;">测序策略</th>
                <th style="padding: 12px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #475569;">覆盖范围</th>
                <th style="padding: 12px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #1e40af;">临床产出</th>
            </tr>
            <tr>
                <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; font-weight: 600;">靶向 Panel</td>
                <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">数十到数百个已知基因。</td>
                <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">常规靶向药物选择与耐药基因检测。</td>
            </tr>
            <tr>
                <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; font-weight: 600;">全外显子组 (WES)</td>
                <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">约 1% 的基因组（所有蛋白质编码区）。</td>
                <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #1e40af;"><strong>[[新抗原]]</strong> 发现、TMB 计算。</td>
            </tr>
            <tr>
                <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; font-weight: 600;">转录组 (RNA-seq)</td>
                <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1;">全部表达的 mRNA 分子。</td>
                <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #1e40af;">验证基因融合、量化 <strong>[[抗原表达水平]]</strong>。</td>
            </tr>
        </table>
    </div>

    <h2 style="background: #f1f5f9; color: #0f172a; padding: 10px 18px; border-radius: 0 6px 6px 0; font-size: 1.25em; margin-top: 40px; border-left: 6px solid #0f172a; font-weight: bold;">权威参考文献与专家点评</h2>

    <div style="font-size: 0.92em; line-height: 1.6; color: #1e293b; margin-top: 15px; border-top: 2.2px solid #0f172a; padding: 15px 25px; background-color: #f8fafc; border-radius: 0 0 10px 10px;">
        <span style="color: #0f172a; font-weight: bold; font-size: 1.05em; display: inline-block; margin-bottom: 15px;">学术参考文献 [Academic Peer Review]</span>
        
        <p style="margin: 12px 0; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; padding-bottom: 10px;">
            [1] <strong>Abdollahi, S., et al. (2025).</strong> <em>Next-generation sequencing in cancer diagnosis and treatment: clinical applications and future directions.</em> <strong>Journal of Personalized Medicine</strong>, 15(4).<br>
            <span style="color: #475569;">[专家点评]：详述了 NGS 在识别治疗靶点和监测耐药演化中的关键角色，是 2026 年精准肿瘤学的最新指南。</span>
        </p>
        
        <p style="margin: 12px 0; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; padding-bottom: 10px;">
            [2] <strong>Sahin, U., & Türeci, Ö. (2018).</strong> <em>Personalized vaccines for cancer immunotherapy.</em> <strong>Science</strong>, 359(6382), 1355-1360.<br>
            <span style="color: #475569;">[专家点评]：论证了 WES 结合 RNA-seq 数据是鉴定功能性新抗原并制备个体化疫苗的“黄金标准”。</span>
        </p>

        <p style="margin: 12px 0; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; padding-bottom: 10px;">
            [3] <strong>Goodwin, S., et al. (2016).</strong> <em>Coming of age: ten years of next-generation sequencing technologies.</em> <strong>Nature Reviews Genetics</strong>, 17(6), 333-351.<br>
            <span style="color: #475569;">[专家点评]：经典综述，回顾了 NGS 各平台（如 Illumina 的 SBS 技术）的技术演进及其在医学中的应用。</span>
        </p>
    </div>

    <h2 style="background: #f1f5f9; color: #0f172a; padding: 10px 18px; border-radius: 0 6px 6px 0; font-size: 1.25em; margin-top: 40px; border-left: 6px solid #0f172a; font-weight: bold;">关键相关概念</h2>
    <div style="background-color: #f8fafc; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 8px; padding: 15px; margin: 20px 0;">
        <ul style="margin: 0; padding-left: 20px; color: #334155;">
            <li style="margin-bottom: 8px;"><strong>[[生物信息学]]：</strong> NGS 产生的 PB 级原始数据转化为临床可解读信息的桥梁。</li>
            <li style="margin-bottom: 8px;"><strong>[[液体活检]] (Liquid Biopsy)：</strong> 利用 NGS 检测外周血中的 <strong>ctDNA</strong>，实现无创、实时的肿瘤监测。</li>
            <li style="margin-bottom: 8px;"><strong>[[三代测序]] (TGS)：</strong> 以单分子长读长为特征，补充 NGS 在复杂结构变异检测中的不足。</li>
        </ul>
    </div>

    <div style="margin: 40px 0; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 8px; overflow: hidden; font-family: 'Helvetica Neue', Arial, sans-serif; font-size: 0.9em;">
        <div style="background-color: #eff6ff; color: #1e40af; padding: 8px 15px; font-weight: bold; text-align: center; border-bottom: 1px solid #dbeafe;">
            二代测序 (NGS) · 知识图谱
        </div>
        <table style="width: 100%; border-collapse: collapse; background-color: #ffffff;">
            <tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;">
                <td style="width: 110px; background-color: #f8fafc; color: #334155; font-weight: 600; padding: 10px 12px; text-align: right; vertical-align: middle; white-space: nowrap;">诊疗依据</td>
                <td style="padding: 10px 15px; color: #334155;">[[循环肿瘤 DNA (ctDNA)]]•[[分子病理分型]]•[[HLA 配型]]</td>
            </tr>
            <tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;">
                <td style="width: 110px; background-color: #f8fafc; color: #334155; font-weight: 600; padding: 10px 12px; text-align: right; vertical-align: middle; white-space: nowrap;">免疫路径</td>
                <td style="padding: 10px 15px; color: #334155;">[[个体化 mRNA 疫苗]]•[[个体化多肽疫苗]]•[[TIL 疗法]]•[[CAR-T 工程]]</td>
            </tr>
            <tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;">
                <td style="width: 110px; background-color: #f8fafc; color: #334155; font-weight: 600; padding: 10px 12px; text-align: right; vertical-align: middle; white-space: nowrap;">演进方向</td>
                <td style="padding: 10px 15px; color: #334155;">[[单细胞 NGS]]•[[空间转录组学]]•[[多组学整合分析]]</td>
            </tr>
        </table>
    </div>

</div>